RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 TTC25Q96NG3 672 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 DTLQ9NZJ0 730 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 NUP205Q92621 2012 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 A0A1W2PQH9 124 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 ANKRD65E5RJM6 399 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 E7ESA3 106 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 NDC80O14777 642 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 C1QTNF8P60827 252 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 EFHC2Q5JST6 749 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 SCML4Q8N228 414 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 TTPALQ9BTX7 342 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 MTMR11A4FU01 709 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 MSI1O43347 362 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 TBC1D4O60343 1298 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 SSTR1P30872 391 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 BBS9Q3SYG4 887 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 VSTM1Q6UX27 236 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 IGDCC3Q8IVU1 814 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 FAM107BQ9H098 131 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 TKTL2Q9H0I9 626 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 OR6C75A6NL08 312 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 PIAS1O75925 651 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 WDCPQ9H6R7 721 aa22.05■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 C2CD2LO14523 706 aa22.04■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 MFSD11O43934 449 aa22.04■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 CDH16O75309 829 aa22.04■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 CXCR3P49682 368 aa22.04■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 NUP93Q8N1F7 819 aa22.04■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 CASP10Q92851 521 aa22.04■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 TOP1MTQ969P6 601 aa22.04■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 PAK5Q9P286 719 aa22.04■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 PLXNA3P51805 1871 aa22.04■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 AVILO75366 819 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 VAV1P15498 845 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 CORO7P57737 925 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 TMED2Q15363 201 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 MAML1Q92585 1016 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 NTAN1Q96AB6 310 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 C8orf48Q96LL4 319 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 SLC9A7Q96T83 725 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 CFAP69A5D8W1 941 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 GMNCA6NCL1 334 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 TIMP1P01033 207 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 DUSP4Q13115 394 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 GPR17Q13304 367 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 MPP2Q14168 576 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 RFX8Q6ZV50 586 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 TAOK1Q7L7X3 1001 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 RNF34Q969K3 372 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 OLFM3Q96PB7 478 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 CCDC77Q9BR77 488 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 PHACTR1Q9C0D0 580 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 H3BRJ5 948 aa22.02■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 METTL18O95568 372 aa22.02■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 IGLV3-25P01717 112 aa22.02■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 SEMA3BQ13214 749 aa22.02■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 QPCTQ16769 361 aa22.02■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 CENPTQ96BT3 561 aa22.02■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 IGSF21Q96ID5 467 aa22.02■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 ETNK1Q9HBU6 452 aa22.02■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 RRN3Q9NYV6 651 aa22.02■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 GMIPQ9P107 970 aa22.02■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms