RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 ARL13BQ3SXY8 428 aa13.71□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 MS4A13Q5J8X5 152 aa13.71□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 PIK3R6Q5UE93 754 aa13.71□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 KIAA1328Q86T90 577 aa13.71□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 MSANTD3Q96H12 275 aa13.71□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 KCNF1Q9H3M0 494 aa13.71□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 HS3ST4Q9Y661 456 aa13.71□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 DCXO43602 365 aa13.71□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 GLULP15104 373 aa13.71□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 TACR2P21452 398 aa13.71□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 MIPP30301 263 aa13.71□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 ZXDAP98168 799 aa13.71□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 GAD2Q05329 585 aa13.71□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 NR1H3Q13133 447 aa13.71□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 GAB4Q2WGN9 574 aa13.71□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 LY6G5CQ5SRR4 150 aa13.71□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 RNF43Q68DV7 783 aa13.71□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF662Q6ZS27 426 aa13.71□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM25Q86YD3 366 aa13.71□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC185Q8N715 623 aa13.71□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 C1orf74Q96LT6 269 aa13.71□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 CHD5Q8TDI0 1954 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 PENKP01210 267 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC175P0C221 793 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 ADH5P11766 374 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 CTHP32929 405 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 GJA4P35212 333 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 VCPP55072 806 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 KIF5AQ12840 1032 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 C5orf22Q49AR2 442 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 MPPE1Q53F39 396 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 SLC44A4Q53GD3 710 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 MPP7Q5T2T1 576 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 FYB2Q5VWT5 728 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 RAP1GAP2Q684P5 730 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 SCYL2Q6P3W7 929 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 C1orf228Q6PIY5 440 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 SLFN11Q7Z7L1 901 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 CHSY1Q86X52 802 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 EDAQ92838 391 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 CHFRQ96EP1 664 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 P2RY11Q96G91 374 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 PEBP4Q96S96 227 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 OSBPL2Q9H1P3 480 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 ARHGEF3Q9NR81 526 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 HEBP1Q9NRV9 189 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 SALL4Q9UJQ4 1053 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 FZD10Q9ULW2 581 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 USP18Q9UMW8 372 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 PIAS3Q9Y6X2 628 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 A0A0U1RQJ8 604 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 F5H5T6 163 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 PRPSAP2O60256 369 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 CACNG3O60359 315 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 CYBBP04839 570 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 ALADP13716 330 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 SLC1A1P43005 524 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 NOP2P46087 812 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 AMPD2Q01433 879 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 PRKCQQ04759 706 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 SIGLEC14Q08ET2 396 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 AUHQ13825 339 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 MESDQ14696 234 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 EFHC2Q5JST6 749 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 ARTNQ5T4W7 220 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 IER5LQ5T953 404 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 MANEALQ5VSG8 457 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf63Q6NUN7 778 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 FBXL22Q6P050 247 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 RFWD3Q6PCD5 774 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 TPGS1Q6ZTW0 290 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF683Q8IZ20 524 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 ATRIPQ8WXE1 791 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 MYEOVQ96EZ4 313 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 BBS2Q9BXC9 721 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 TSGA10Q9BZW7 698 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 DUSP10Q9Y6W6 482 aa13.69□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 MUC3AQ02505 3323 aa13.68□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa13.68□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms