RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258796.11

TTYH3-201, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTYH3, Length 4,840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-201ENST00000258796 DHRSXQ8N5I4 330 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 NDNQ99608 321 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 ELP3Q9H9T3 547 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 TSHRP16473 764 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 NOMO3P69849 1222 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 RAD51Q06609 339 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 TWF1Q12792 350 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 TRAF2Q12933 501 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 LDLRP01130 860 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 CREB1P16220 341 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 ARHGAP8P85298 464 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 ARCQ7LC44 396 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 SPATA17Q96L03 361 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 APBA2Q99767 749 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 IMPAD1Q9NX62 359 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 NR1H2P55055 460 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 FAM81AQ8TBF8 368 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 CPB2Q96IY4 423 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 E5RJQ4 531 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 PGK2P07205 417 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 RAD23AP54725 363 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 BST2Q10589 180 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 ZPBP2Q6X784 338 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 SLC22A9Q8IVM8 553 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 URGCPQ8TCY9 931 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 NSMCE2Q96MF7 247 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 BDH2Q9BUT1 245 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 GIMAP4Q9NUV9 329 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 NCAM2O15394 837 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 VAPBO95292 243 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 CYP51A1Q16850 503 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 NDUFAF1Q9Y375 327 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 OTULINQ96BN8 352 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 GAKO14976 1311 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.828e-7■■■□□ 15.1
TTYH3-201ENST00000258796 FOLH1Q04609 750 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 AAGABQ6PD74 315 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 TTC23LQ6PF05 361 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 RRN3Q9NYV6 651 aa20.15■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 CASZ1Q86V15 1759 aa20.14■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa20.14■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 CTSHP09668 335 aa20.14■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 ATXN8OSP0DMR3 200 aa20.14■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 PLK1P53350 603 aa20.14■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 CHSY1Q86X52 802 aa20.14■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.14■□□□□ 0.82
TTYH3-201ENST00000258796 C5orf60A6NFR6 353 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 TOMM70O94826 608 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 UPP2O95045 317 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 TPBGLP0DKB5 382 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 YY1P25490 414 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 TJAP1Q5JTD0 557 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 BCL9O00512 1426 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 C5orf58C9J3I9 102 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 STX7O15400 261 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 WASHC5Q12768 1159 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 KRT33BQ14525 404 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 STK32CQ86UX6 486 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 MBOAT7Q96N66 472 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 C9orf16Q9BUW7 83 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 NAB1Q13506 487 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 ACVR2BQ13705 512 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 NPY5RQ15761 445 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 CACHD1Q5VU97 1274 aa20.14■□□□□ 0.81
TTYH3-201ENST00000258796 HEATR4Q86WZ0 1026 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms