RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 OR56A5P0C7T3 313 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 PTSQ03393 145 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 C2CD6Q53TS8 623 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF621Q6ZSS3 439 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 PLEKHH3Q7Z736 793 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 CDH24Q86UP0 819 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 MAGEB18Q96M61 343 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 MTA3Q9BTC8 594 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 NAT9Q9BTE0 207 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ISCUQ9H1K1 167 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 WHRNQ9P202 907 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF112Q9UJU3 913 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 CLCN3P51790 818 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 THOP1P52888 689 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 SLC47A2Q86VL8 602 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 REPS1Q96D71 796 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 PRMT3O60678 531 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 RAD23AP54725 363 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ADIGQ0VDE8 80 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ARMC3Q5W041 872 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF280DQ6N043 979 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 MPZL3Q6UWV2 235 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 A0A088AWK7 358 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 O00370 1275 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 JCHAINP01591 159 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 TBCDQ9BTW9 1192 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ATXN3LQ9H3M9 355 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 OGTO15294 1046 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 SPIDRQ14159 915 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 EDEM1Q92611 657 aa16.81■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 MYL12BO14950 172 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 VDRP11473 427 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 SLC1A6P48664 564 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 RENBPP51606 427 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 FAM171A1Q5VUB5 890 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 CHPFQ8IZ52 775 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 USP38Q8NB14 1042 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 FAM151AQ8WW52 585 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 RIT2Q99578 217 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 TNFSF13BQ9Y275 285 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ERVK-7P63135 1459 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 STK4Q13043 487 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ERMARDQ5T6L9 678 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 XRRA1Q6P2D8 792 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 TAAR1Q96RJ0 339 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 KANSL3Q9P2N6 904 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 AMD1P17707 334 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 HSD17B3P37058 310 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 IL12RB1P42701 662 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 NDUFA5Q16718 116 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 TTC23Q5W5X9 447 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ILDR2Q71H61 639 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 DET1Q7L5Y6 550 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ATG4AQ8WYN0 398 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 GPRC5CQ9NQ84 441 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 SLCO1B7G3V0H7 640 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 OR10H2O60403 315 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 SEC22BO75396 215 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 PDE5AO76074 875 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ITGA3P26006 1051 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 PON1P27169 355 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 FAM131BQ86XD5 332 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 CD302Q8IX05 232 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 APOL4Q9BPW4 351 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 CNGB3Q9NQW8 809 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 MAGEA13PA6NCF6 341 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 KRT6AP02538 564 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 KRT6BP04259 564 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 MPOP05164 745 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 FASP25445 335 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 KRT6CP48668 564 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 MIEF2Q96C03 454 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ATG4CQ96DT6 458 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 ICAM1P05362 532 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 SERPINF2P08697 491 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 CYP2F1P24903 491 aa16.8■□□□□ 0.28
LAMC1-201ENST00000258341 RXRGP48443 463 aa16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms