RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 NOX5Q96PH1 765 aa23.1■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 ANO10Q9NW15 660 aa23.1■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 TAB2Q9NYJ8 693 aa23.1■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 SPTBN2O15020 2390 aa23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 CAPN9O14815 690 aa23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 MBD3O95983 291 aa23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 C7P10643 843 aa23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 KRT9P35527 623 aa23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 CREB5Q02930 508 aa23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF234Q14588 700 aa23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 PTPN20Q4JDL3 420 aa23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 OLFML1Q6UWY5 402 aa23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 ADIPOR2Q86V24 386 aa23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 PGBD3Q8N328 593 aa23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 MYEOVQ96EZ4 313 aa23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 RXFP3Q9NSD7 469 aa23.09■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 GON4LQ3T8J9 2241 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 HSF2BPO75031 334 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF217O75362 1048 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 CAVIN2O95810 425 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 CYP11B1P15538 503 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 RAPGEF1Q13905 1077 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 FUT11Q495W5 492 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 MS4A13Q5J8X5 152 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 EFHC1Q5JVL4 640 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 LPCAT2Q7L5N7 544 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 SLC26A9Q7LBE3 791 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 WFDC5Q8TCV5 224 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 SORCS1Q8WY21 1168 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 STK33Q9BYT3 514 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 CIPCQ9C0C6 399 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 GANQ9H2C0 597 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 SMOC1Q9H4F8 434 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 ABCB8Q9NUT2 735 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 FANCLQ9NW38 375 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 GGA2Q9UJY4 613 aa23.08■■□□□ 1.29
PRADC1-201ENST00000258083 THADAQ6YHU6 1953 aa23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 F8VZ95 297 aa23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 PES1O00541 588 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 TBL1XO60907 577 aa23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 ERBB2P04626 1255 aa23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 STARD3Q14849 445 aa23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 DCAF6Q58WW2 860 aa23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 SASS6Q6UVJ0 657 aa23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 DEFB106AQ8N104 65 aa23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 AHI1Q8N157 1196 aa23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 FIBINQ8TAL6 211 aa23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 BTN2A3PQ96KV6 586 aa23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 VPS16Q9H269 839 aa23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 TMEM245Q9H330 911 aa23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 CEP83Q9Y592 693 aa23.07■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 KCNU1A8MYU2 1149 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 APOEP02649 317 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 PRKCHP24723 683 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 PTGER3P43115 390 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 SNX16P57768 344 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 RPS24P62847 133 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 STX1AQ16623 288 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 PTPRNQ16849 979 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 SLC36A4Q6YBV0 504 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 CHST9Q7L1S5 443 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 CYP2U1Q7Z449 544 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 TMEFF1Q8IYR6 380 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 SLC6A17Q9H1V8 727 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 CKAP5Q14008 2032 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 NUP205Q92621 2012 aa23.06■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 LRRC10BA6NIK2 292 aa23.05■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF18P17022 549 aa23.05■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 CD70P32970 193 aa23.05■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 GABRB2P47870 512 aa23.05■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 CDK17Q00537 523 aa23.05■■□□□ 1.28
PRADC1-201ENST00000258083 SLC6A3Q01959 620 aa23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms