RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 RBP5P82980 135 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 XIAPP98170 497 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 POU5F1BQ06416 359 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC30AQ86WT1 665 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 OR6Y1Q8NGX8 325 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 CDKL2Q92772 493 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 EBF3Q9H4W6 596 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF195O14628 629 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNA4P22459 653 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PTPN9P43378 593 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC26A2P50443 739 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 CDK7P50613 346 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 CCNIQ14094 377 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 ATG14Q6ZNE5 492 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.79■■□□□ 1.24
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HTATSF1-201ENST00000218364 PROCP04070 461 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 FDFT1P37268 417 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 GABBR2O75899 941 aa22.78■■□□□ 1.24
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HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC8BQ6P9F7 803 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 SCUBE3Q8IX30 993 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 POU5F2Q8N7G0 328 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PYDC1Q8WXC3 89 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 VCX3BQ9H321 246 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 HBP1O60381 514 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 DGKIO75912 1065 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PHKA2P46019 1235 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 HARS2P49590 506 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
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HTATSF1-201ENST00000218364 PNPOQ9NVS9 261 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 DPP3Q9NY33 737 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC17A6Q9P2U8 582 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 KAT6AQ92794 2004 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 A6NJR5 290 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 SOCS7O14512 581 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 ASPHQ12797 758 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 RASSF3Q86WH2 238 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 C10orf107Q8IVU9 208 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 HTR3CQ8WXA8 447 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 CMTM5Q96DZ9 223 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.78■■□□□ 1.24
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HTATSF1-201ENST00000218364 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 DTLQ9NZJ0 730 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 CDH22Q9UJ99 828 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A0A0MRY4 1105 aa22.77■■□□□ 1.24
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HTATSF1-201ENST00000218364 HACE1Q8IYU2 909 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
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HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA13Q96N96 652 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 OLFM3Q96PB7 478 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 HACD1B0YJ81 288 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 ITGA2BP08514 1039 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PGAM1P18669 254 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 ARRB2P32121 409 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX16P57768 344 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PDPK2PQ6A1A2 396 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 COPG2Q9UBF2 871 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 VAV1P15498 845 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 PRDX6P30041 224 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 RPL26P61254 145 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 DEUP1Q05D60 604 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 LIN52Q52LA3 116 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 SFT2D3Q587I9 215 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA16Q9BXB7 569 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL4Q9C0H6 718 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 C22orf31O95567 290 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 TREML2Q5T2D2 321 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR90Q96KV7 1748 aa22.76■■□□□ 1.23
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