RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	ANGPT2	O15123	496 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	ALOX15B	O15296	676 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	TNFRSF21	O75509	655 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	PCSK6	P29122	969 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	ALCAM	Q13740	583 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	DCAF6	Q58WW2	860 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	FBXO27	Q8NI29	283 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	EXT2	Q93063	718 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	MAGED4	Q96JG8	741 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	HIPK3	Q9H422	1215 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	PSTPIP1	O43586	416 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	MED24	O75448	989 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	MT-CO1	P00395	513 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	CPA3	P15088	417 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	SNX16	P57768	344 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	EXD1	Q8NHP7	514 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	RIN3	Q8TB24	985 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	CEP95	Q96GE4	821 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	PNPO	Q9NVS9	261 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	TEX28	O15482	410 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	CHRNB2	P17787	502 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	SNAP25	P60880	206 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	PRKG1	Q13976	671 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	TGFBI	Q15582	683 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	DHFR2	Q86XF0	187 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	FBXO11	Q86XK2	927 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	SFRP1	Q8N474	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	LRRC39	Q96DD0	335 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	TASP1	Q9H6P5	420 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	DCC	P43146	1447 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1W2PQ72	361 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC16A4	O15374	487 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	DNAJA2	O60884	412 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	GRIA3	P42263	894 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	ZBED5	Q49AG3	693 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	RNF135	Q8IUD6	432 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	ISOC1	Q96CN7	298 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	EBF1	Q9UH73	591 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	VILL	O15195	856 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	TIPRL	O75663	272 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	TCEA3	O75764	348 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	CCND2	P30279	289 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	CDK8	P49336	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	VAC14	Q08AM6	782 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	AGK	Q53H12	422 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	TOR3A	Q9H497	397 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF221	Q9UK13	617 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-231	ENST00000639895	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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