RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-208ENST00000638481 ARPP19P56211 112 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 STAT4Q14765 748 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 LRRC14Q15048 493 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 KYNUQ16719 465 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 DCAF6Q58WW2 860 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 SYPL2Q5VXT5 272 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 KAZNQ674X7 775 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 SCYL2Q6P3W7 929 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 RELL1Q8IUW5 271 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 TTC9BQ8N6N2 239 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 ANKRD42Q8N9B4 389 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 STKLD1Q8NE28 680 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 CCHCR1Q8TD31 782 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 BADQ92934 168 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 SLC2A13Q96QE2 648 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 POPDC2Q9HBU9 364 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 ZBBXA8MT70 800 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 TBC1D4O60343 1298 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 CDH16O75309 829 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 ALADP13716 330 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 BRAFP15056 766 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 CPB1P15086 417 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 KDELR1P24390 212 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 CETN2P41208 172 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 SLC5A3P53794 718 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 GALNTL6Q49A17 601 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 NUGGCQ68CJ6 796 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 ANKS3Q6ZW76 656 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 SPATA21Q7Z572 469 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 SCN4BQ8IWT1 228 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 ATAD1Q8NBU5 361 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 EBF2Q9HAK2 575 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 TNFRSF10BO14763 440 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 UBOX5O94941 541 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 LTFP02788 710 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 ABHD2P08910 425 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 DESP17661 470 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 GPR15P49685 360 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 SULT1E1P49888 294 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 COPS2P61201 443 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 LMNB2Q03252 620 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.073e-6■■■□□ 16.5
SPIN3-208ENST00000638481 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 SDHAF4Q5VUM1 108 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 GRAMD1AQ96CP6 724 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 NEU2Q9Y3R4 380 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 USP3Q9Y6I4 520 aa15.47■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 CEP290O15078 2479 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 VNN2O95498 520 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 NQO1P15559 274 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 RPL17P18621 184 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 STX2P32856 288 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 NOS2P35228 1153 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 PTPN7P35236 360 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 NCALDP61601 193 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 DDR2Q16832 855 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 USP41Q3LFD5 358 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 IZUMO3Q5VZ72 239 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 PM20D1Q6GTS8 502 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 C7orf61Q8IZ16 206 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 KCTD6Q8NC69 237 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 NT5C3BQ969T7 300 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 MAGEB18Q96M61 343 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 ZNF558Q96NG5 402 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 YME1L1Q96TA2 773 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 NPY6RQ99463 290 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 FAM118BQ9BPY3 351 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 CRISPLD1Q9H336 500 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 ECT2Q9H8V3 914 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 CDY1Q9Y6F8 540 aa15.46■□□□□ 0.07
SPIN3-208ENST00000638481 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa15.45■□□□□ 0.06
SPIN3-208ENST00000638481 MTMR11A4FU01 709 aa15.45■□□□□ 0.06
SPIN3-208ENST00000638481 H7C4K7 107 aa15.45■□□□□ 0.06
SPIN3-208ENST00000638481 SOAT2O75908 522 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms