RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635997.1

NEDD4L-238, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5 BASIC

Gene NEDD4L, Length 4,402 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	14.74	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	FBXO21	O94952	628 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	MFN1	Q8IWA4	741 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	BAP1	Q92560	729 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	ANXA9	O76027	345 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	RHOBTB1	O94844	696 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	RHOA	P61586	193 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLC6A3	Q01959	620 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	SHC3	Q92529	594 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	FICD	Q9BVA6	458 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	DRC3	Q9H069	523 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	MYO7A	Q13402	2215 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	OR4Q2	P0C623	313 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	GJA8	P48165	433 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	MEA1	Q16626	185 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	DDR2	Q16832	855 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	SYTL3	Q4VX76	610 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	GAN	Q9H2C0	597 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	SENP1	Q9P0U3	644 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	ALS2	Q96Q42	1657 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997		A0A0B4J269	797 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	SSTR1	P30872	391 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	HMOX2	P30519	316 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	RASIP1	Q5U651	963 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	MARC1	Q5VT66	337 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	PTPN7	P35236	360 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	ABCG1	P45844	678 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCNG2	Q16589	344 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	CD274	Q9NZQ7	290 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	RAMP2	O60895	175 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	CAND2	O75155	1236 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	MT-CO1	P00395	513 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	PAEP	P09466	180 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	RABGGTB	P53611	331 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	PLIN5	Q00G26	463 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	FMO1	Q01740	532 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	MCL1	Q07820	350 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	GBP5	Q96PP8	586 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	SUPT3H	O75486	399 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	RBL1	P28749	1068 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	CNGA2	Q16280	664 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	FSCB	Q5H9T9	825 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	SPATA21	Q7Z572	469 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	LGI2	Q8N0V4	545 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	C3orf20	Q8ND61	904 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05

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