RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615025.4

TNS1-221, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-221ENST00000615025 FLCNQ8NFG4 579 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 NRCAMQ92823 1304 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CYP2A7P20853 494 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 STX5Q13190 355 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 TMEM86AQ8N2M4 240 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PRRG3Q9BZD7 231 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 JAK1P23458 1154 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 BDNFP23560 247 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CNTFP26441 200 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CSHL1Q14406 222 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PALB2Q86YC2 1186 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 DCLK3Q9C098 648 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 AHSPQ9NZD4 102 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 RAD54BQ9Y620 910 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.619e-7■■■□□ 18.7
TNS1-221ENST00000615025 FKTNO75072 461 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 HSD17B3P37058 310 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CLK1P49759 484 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 NUDT2P50583 147 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 GSTA3Q16772 222 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CES5AQ6NT32 575 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 NLRP9Q7RTR0 991 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 NSL1Q96IY1 281 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PADI4Q9UM07 663 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SLC15A5A6NIM6 579 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PDZK1P1A8MUH7 402 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 RNF103O00237 685 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CCNG1P51959 295 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 FGD2Q7Z6J4 655 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 BRSK2Q8IWQ3 736 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MCOLN2Q8IZK6 566 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ZNF606Q8WXB4 792 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CNDP1Q96KN2 507 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 UROC1Q96N76 676 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ZNF558Q96NG5 402 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 OSGEPQ9NPF4 335 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 VPS51Q9UID3 782 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ARHGAP23Q9P227 1491 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MAGEB16A2A368 324 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ITGB6P18564 788 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PWP1Q13610 501 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CXCL17Q6UXB2 119 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ARHGEF19Q8IW93 802 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 HPSEQ9Y251 543 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 COPAP53621 1224 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 POU6F1Q14863 301 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SCUBE3Q8IX30 993 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 TMEM159Q96B96 161 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ALBP02768 609 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 USP17L7P0C7H9 530 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MLH1P40692 756 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MPP3Q13368 585 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 NTRK3Q16288 839 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 FIGNQ5HY92 759 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CBWD3Q5JTY5 395 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CBWD5Q5RIA9 395 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ADAM32Q8TC27 787 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 GAD1Q99259 594 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ELOVL6Q9H5J4 265 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 USP20Q9Y2K6 914 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 IRF6O14896 467 aa11.21□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 RECQL4O94761 1208 aa11.21□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 RPN2P04844 631 aa11.21□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PAEPP09466 180 aa11.21□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.21□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.21□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SERPINB5P36952 375 aa11.21□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CREMQ03060 361 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms