RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	FBXO10	Q9UK96	956 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	USP34	Q70CQ2	3546 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANTXRL	A6NF34	631 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	CFI	P05156	583 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	KRT9	P35527	623 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	BPIFB4	P59827	614 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	ST8SIA6	P61647	398 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	RING1	Q06587	406 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAN2A1	Q16706	1144 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	GEN1	Q17RS7	908 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	AHI1	Q8N157	1196 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	FOXJ1	Q92949	421 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	RNF34	Q969K3	372 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	GBP4	Q96PP9	640 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACOX2	Q99424	681 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	RAD54B	Q9Y620	910 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	MYH10	P35580	1976 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197		A0A1W2PQF6	199 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACSL4	O60488	711 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	TBL1X	O60907	577 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	MOCS3	O95396	460 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	EPHX1	P07099	455 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	GNS	P15586	552 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	NDUFV2	P19404	249 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	OXTR	P30559	389 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	GPD2	P43304	727 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	MTA1	Q13330	715 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	NNT	Q13423	1086 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDH18	Q13634	790 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	MPP7	Q5T2T1	576 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHST9	Q7L1S5	443 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	TCEAL3	Q969E4	200 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	AZIN2	Q96A70	460 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	STIM2	Q9P246	746 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NPIPB4-222	ENST00000614197	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		11.4	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	C4orf47	A7E2U8	309 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	MEI4	A8MW99	385 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	CALCA	P01258	141 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	SYP	P08247	313 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC2A3	P11169	496 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC9A1	P19634	815 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	CD6	P30203	668 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	PTGER3	P43115	390 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDK17	Q00537	523 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF33A	Q06730	810 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF234	Q14588	700 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	FUT11	Q495W5	492 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	VWA3B	Q502W6	1294 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	BEND5	Q7L4P6	421 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		11.39	□□□□□ -0.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms