RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 UBR7Q8N806 425 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 SLC39A7Q92504 469 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 KAT5Q92993 513 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 THAP9Q9H5L6 903 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.15■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 E2F8A0AVK6 867 aa20.15■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 FLRT2O43155 660 aa20.15■□□□□ 0.82
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SGMS1-208ENST00000608287 SLC8A3P57103 927 aa20.15■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.15■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM270Q6UE05 265 aa20.15■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.15■□□□□ 0.82
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SGMS1-208ENST00000608287 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-208ENST00000608287 CYP26A1O43174 497 aa20.14■□□□□ 0.81
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SGMS1-208ENST00000608287 C12orf40Q86WS4 652 aa20.14■□□□□ 0.81
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SGMS1-208ENST00000608287 ZNF605Q86T29 641 aa20.13■□□□□ 0.81
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SGMS1-208ENST00000608287 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.13■□□□□ 0.81
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SGMS1-208ENST00000608287 HESX1Q9UBX0 185 aa20.13■□□□□ 0.81
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SGMS1-208ENST00000608287 NDUFV2P19404 249 aa20.12■□□□□ 0.81
SGMS1-208ENST00000608287 PGFP49763 221 aa20.12■□□□□ 0.81
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SGMS1-208ENST00000608287 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
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SGMS1-208ENST00000608287 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa20.12■□□□□ 0.81
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SGMS1-208ENST00000608287 MAN2A1Q16706 1144 aa20.11■□□□□ 0.81
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SGMS1-208ENST00000608287 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.11■□□□□ 0.81
SGMS1-208ENST00000608287 CADM4Q8NFZ8 388 aa20.11■□□□□ 0.81
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SGMS1-208ENST00000608287 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.11■□□□□ 0.81
SGMS1-208ENST00000608287 GAREM1Q9H706 876 aa20.11■□□□□ 0.81
SGMS1-208ENST00000608287 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.11■□□□□ 0.81
SGMS1-208ENST00000608287 MAST4O15021 2626 aa20.11■□□□□ 0.81
SGMS1-208ENST00000608287 A0A1W2PQF6 199 aa20.1■□□□□ 0.81
SGMS1-208ENST00000608287 TULP2O00295 520 aa20.1■□□□□ 0.81
SGMS1-208ENST00000608287 O00370 1275 aa20.1■□□□□ 0.81
SGMS1-208ENST00000608287 GFRA2O00451 464 aa20.1■□□□□ 0.81
SGMS1-208ENST00000608287 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SGMS1-208ENST00000608287 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
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