RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601252.1

TIMM50-215, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, human

TSL 5

Gene TIMM50, Length 1,737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM50-215	ENST00000601252	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	NT5C3B	Q969T7	300 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	KLHL29	Q96CT2	875 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	MTBP	Q96DY7	904 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	PCED1B	Q96HM7	432 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252		M0QZQ0	153 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	BEST1	O76090	585 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	TPSB2	P20231	275 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	L1CAM	P32004	1257 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	ELK3	P41970	407 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	AIF1	P55008	147 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	MAP3K7CL	P57077	242 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	NCALD	P61601	193 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	CDK16	Q00536	496 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	TPSAB1	Q15661	275 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	RAB41	Q5JT25	222 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	NPNT	Q6UXI9	565 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	CHSY1	Q86X52	802 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	RNF169	Q8NCN4	708 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	APOPT1	Q96IL0	206 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	NPY6R	Q99463	290 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	ACBD6	Q9BR61	282 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TIMM50-215	ENST00000601252	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		14.71	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	GCAT	O75600	419 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	B3GAT3	O94766	335 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	UNC5C	O95185	931 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	POMC	P01189	267 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	IL1B	P01584	269 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	CKB	P12277	381 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	CNTF	P26441	200 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	FOXN2	P32314	431 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	ARL4A	P40617	200 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	TKTL1	P51854	596 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	DAOA	P59103	153 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	DNAJC3	Q13217	504 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	MSS51	Q4VC12	460 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	CCNJL	Q8IV13	435 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	BANP	Q8N9N5	519 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	USP29	Q9HBJ7	922 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	RGS18	Q9NS28	235 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	RRN3	Q9NYV6	651 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	FZD10	Q9ULW2	581 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	14.69	□□□□□ -0.06	1e-6	■■■■■ 66.8
TIMM50-215	ENST00000601252	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252		C9IYK1	514 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	KBTBD13	C9JR72	458 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	LPXN	O60711	386 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	EOMES	O95936	686 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	TYMP	P19971	482 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	SERPINB9	P50453	376 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	ARHGEF6	Q15052	776 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	DCAF6	Q58WW2	860 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	LRRC6	Q86X45	466 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	FITM2	Q8N6M3	262 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	CCDC185	Q8N715	623 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	MZB1	Q8WU39	189 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	INPP5D	Q92835	1189 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	MYLPF	Q96A32	169 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	SLC9A7	Q96T83	725 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	SMO	Q99835	787 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	MKS1	Q9NXB0	559 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TIMM50-215	ENST00000601252	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06

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