RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592759.5

POP4-213, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 4

Gene POP4, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP4-213	ENST00000592759	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	TMEM25	Q86YD3	366 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	AZIN2	Q96A70	460 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	OTUB2	Q96DC9	234 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	CCDC42	Q96M95	316 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	MCEE	Q96PE7	176 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	DCLK3	Q9C098	648 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	RRN3	Q9NYV6	651 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	CA14	Q9ULX7	337 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	CCP110	O43303	1012 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	ACSL4	O60488	711 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	MYBL1	P10243	752 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	GPD1	P21695	349 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	GJA4	P35212	333 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	OPRD1	P41143	372 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	MRE11	P49959	708 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	SGSH	P51688	502 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	HDAC4	P56524	1084 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	PFKP	Q01813	784 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	MESP2	Q0VG99	397 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	NME3	Q13232	169 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	PPP2R5D	Q14738	602 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	CPXM2	Q8N436	756 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	ATP2A3	Q93084	1043 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	TRIM11	Q96F44	468 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	PARVA	Q9NVD7	372 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	COX16	Q9P0S2	106 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	LATS1	O95835	1130 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	ALAD	P13716	330 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	SDC4	P31431	198 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	CTH	P32929	405 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	STARD6	P59095	220 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	ATP11A	P98196	1134 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	DEUP1	Q05D60	604 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	FZD5	Q13467	585 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	RNF43	Q68DV7	783 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	H2AFV	Q71UI9	128 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	STRADA	Q7RTN6	431 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	C12orf40	Q86WS4	652 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	BTBD6	Q96KE9	485 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	CNPY3	Q9BT09	278 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	DEF6	Q9H4E7	631 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	MARK1	Q9P0L2	795 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	TFR2	Q9UP52	801 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	NUP205	Q92621	2012 aa		13	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		12.99	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	RCCD1	A6NED2	376 aa		12.99	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	TMEM221	A6NGB7	291 aa		12.99	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		12.99	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759		M0R296	226 aa		12.99	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	NDUFA10	O95299	355 aa		12.99	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	NFATC1	O95644	943 aa		12.99	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	F9	P00740	461 aa		12.99	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
POP4-213	ENST00000592759	TMEM253	P0C7T8	217 aa		12.99	□□□□□ -0.33

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