RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 SERPINB9P50453 376 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP11AP98196 1134 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ADCY1Q08828 1119 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJC3Q13217 504 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 KIZQ2M2Z5 673 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC45A4Q5BKX6 768 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 MARCH8Q5T0T0 291 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 C9orf57Q5W0N0 161 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 LVRNQ6Q4G3 990 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM47EQ6ZV65 393 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 STRADAQ7RTN6 431 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC26A11Q86WA9 606 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC30AQ86WT1 665 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 CHSY1Q86X52 802 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 PLD5Q8N7P1 536 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD52Q8NB46 1076 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 APPL2Q8NEU8 664 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC35F5Q8WV83 523 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 DCAKDQ8WVC6 231 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC44A1Q8WWI5 657 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC37BQ96QE4 947 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 TUBB6Q9BUF5 446 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM49BQ9NUQ9 324 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ETNK2Q9NVF9 386 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 GDAP2Q9NXN4 497 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SNTG2Q9NY99 539 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 STAP1Q9ULZ2 295 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 TEX264Q9Y6I9 313 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 I3L4J1 428 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 HUS1O60921 280 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GCATO75600 419 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM155BO75949 473 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RECQL4O94761 1208 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 UNC5CO95185 931 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP6V1G2O95670 118 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 IL1BP01584 269 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GNAT1P11488 350 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 NEFHP12036 1026 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 FDFT1P37268 417 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL34P49207 117 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 AIF1P55008 147 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CDK16Q00536 496 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 NAB1Q13506 487 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TAF5Q15542 800 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB6Q15916 424 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PMF1Q6P1K2 205 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 NPNTQ6UXI9 565 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CCNJLQ8IV13 435 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CRYBG2Q8N1P7 616 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PQLC3Q8N755 202 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 BANPQ8N9N5 519 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 INPP5DQ92835 1189 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CFAP36Q96G28 342 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM55Q9BYV6 548 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 LRMDAQ9H2I8 198 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MKS1Q9NXB0 559 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 AP4E1Q9UPM8 1137 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 HEY1Q9Y5J3 304 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CITO14578 2027 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 KPNA7A9QM74 516 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 COPEO14579 308 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GPR32O75388 356 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 BANF1O75531 89 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GRAP2O75791 330 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXO21O94952 628 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.4 ms