RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589475.1

EFTUD2-213, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 200 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-213ENST00000589475 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 DDIT4Q9NX09 232 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TRIM10Q9UDY6 481 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SALL4Q9UJQ4 1053 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 DNMT3LQ9UJW3 386 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ALG6Q9Y672 507 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MTCH2Q9Y6C9 303 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 DUSP10Q9Y6W6 482 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM170AA1A519 330 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 USP27XA6NNY8 438 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 M0QYT0 321 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 RFXAPO00287 272 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CES2O00748 559 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MDM4O15151 490 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 LRCH4O75427 683 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 RFPL2O75678 378 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 GJB6O95452 261 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 LATS1O95835 1130 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 GLP2RO95838 553 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ABL1P00519 1130 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 OAS1P00973 400 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 IGLV3-25P01717 112 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 FYNP06241 537 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MYL4P12829 197 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TNNT1P13805 278 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TCP1P17987 556 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 COMTP21964 271 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CTNNA2P26232 953 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 WEE1P30291 646 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CASQ1P31415 396 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CCR1P32246 355 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 HTR7P34969 479 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 AVPR1AP37288 418 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MTHFRP42898 656 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CDR1P51861 262 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 RWDD2BP57060 319 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TBX4P57082 545 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ATP11AP98196 1134 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SCAPQ12770 1279 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ADAM15Q13444 863 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 COL19A1Q14993 1142 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 RPS6KA1Q15418 735 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TAF5Q15542 800 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CCDC14Q49A88 953 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 EFHC2Q5JST6 749 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SEL1L2Q5TEA6 688 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF787Q6DD87 383 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 HFE2Q6ZVN8 426 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 GAREM2Q75VX8 874 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 BNIPLQ7Z465 357 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 GPR149Q86SP6 731 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TAC4Q86UU9 113 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 NT5DC3Q86UY8 548 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MAP7D3Q8IWC1 876 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 UNC45BQ8IWX7 931 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC35F6Q8N357 371 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 EMC1Q8N766 993 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 KIF18AQ8NI77 898 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 EDEM1Q92611 657 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 RNF34Q969K3 372 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 NTAN1Q96AB6 310 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PLD4Q96BZ4 506 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 HES6Q96HZ4 224 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CFAP57Q96MR6 1250 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 LRRC3Q9BY71 257 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 DCLK3Q9C098 648 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 IGFLR1Q9H665 355 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TASP1Q9H6P5 420 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 KIF9Q9HAQ2 790 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 NMUR1Q9HB89 426 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 DONSONQ9NYP3 566 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 GDE1Q9NZC3 331 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MARCH2Q9P0N8 246 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms