RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC5A5	Q92911	643 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	UIMC1	Q96RL1	719 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PARVG	Q9HBI0	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MSH4	O15457	936 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PPIP5K2	O43314	1243 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MED24	O75448	989 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PSMD10	O75832	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ERLIN2	O94905	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SLITRK3	O94933	977 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	LYPLA2	O95372	231 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GCNT3	O95395	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ASMTL	O95671	621 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	HSPA6	P17066	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SFN	P31947	248 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF131	P52739	623 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GHRHR	Q02643	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CUL1	Q13616	776 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC41	Q15345	812 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	LENG9	Q96B70	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RUFY1	Q96T51	708 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	VCPKMT	Q9H867	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MYH10	P35580	1976 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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