RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 NUP205Q92621 2012 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 NOX5Q96PH1 765 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM62Q9BVG3 475 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CIPCQ9C0C6 399 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ZMYND15Q9H091 742 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 VPS16Q9H269 839 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SEMA4GQ9NTN9 838 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TAB2Q9NYJ8 693 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PRRT4C9JH25 899 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 E5RJQ4 531 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ADAM23O75077 832 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 LATS1O95835 1130 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PENKP01210 267 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SDHBP21912 280 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF445P59923 1031 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CREB5Q02930 508 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 LMNB2Q03252 620 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 KCNMA1Q12791 1236 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PDCLQ13371 301 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 E2F5Q15329 346 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC6Q16204 474 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 STX1AQ16623 288 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 MEA1Q16626 185 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 GEN1Q17RS7 908 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PLK5Q496M5 336 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 DCAF6Q58WW2 860 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC183Q5T5S1 534 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 MSANTD2Q6P1R3 559 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM110Q86TL2 294 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 C11orf74Q86VG3 221 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SLC47A2Q86VL8 602 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 RASSF3Q86WH2 238 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 GAS2L3Q86XJ1 694 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ADAM32Q8TC27 787 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 RLN3Q8WXF3 142 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 RNF34Q969K3 372 aa8.66□□□□□ -1.02
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PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SPACA7Q96KW9 195 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINB11Q96P15 392 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ACOX2Q99424 681 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SIX2Q9NPC8 291 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 FANCLQ9NW38 375 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 STIM2Q9P246 746 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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PTPRM-214ENST00000583153 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 WASH3PC4AMC7 463 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TIMM44O43615 452 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ACSL4O60488 711 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TBL1XO60907 577 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 LRP3O75074 770 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 GRAP2O75791 330 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 APOEP02649 317 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 UCHL3P15374 230 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 RPL34P49207 117 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP8P85298 464 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CDK17Q00537 523 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 MYL5Q02045 173 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 RING1Q06587 406 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 STARD3Q14849 445 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 KRT31Q15323 416 aa8.65□□□□□ -1.02
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