RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 SPATA1Q5VX52 437 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 C9orf57Q5W0N0 161 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 KIAA0895LQ68EN5 471 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 APOA5Q6Q788 366 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 MPZL3Q6UWV2 235 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ZFAND4Q86XD8 727 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 MCEMP1Q8IX19 187 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PDCL2Q8N4E4 241 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PDILTQ8N807 584 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TTC13Q8NBP0 860 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 OR2T3Q8NH03 318 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 OR4C6Q8NH72 309 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ATL2Q8NHH9 583 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PRR7Q8TB68 274 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 HAS1Q92839 578 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ARRDC3Q96B67 414 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 P2RY11Q96G91 374 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ABHD17AQ96GS6 310 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SERAC1Q96JX3 654 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 APOLD1Q96LR9 279 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 GBP4Q96PP9 640 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 KIFC3Q9BVG8 833 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 BBS2Q9BXC9 721 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SLC12A9Q9BXP2 914 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 LHX5Q9H2C1 402 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TMEM134Q9H6X4 195 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 GRPEL1Q9HAV7 217 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ABCB6Q9NP58 842 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CYLDQ9NQC7 956 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PRDM8Q9NQV8 689 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 FOXD4L1Q9NU39 408 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ELOVL2Q9NXB9 296 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 VPS54Q9P1Q0 977 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SEL1LQ9UBV2 794 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 FBXO10Q9UK96 956 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 GTF3C4Q9UKN8 822 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PHTF1Q9UMS5 762 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SNX14Q9Y5W7 946 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 UBE4BO95155 1302 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CITO14578 2027 aa2.56□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 NEMP2A6NFY4 417 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PRR19A6NJB7 356 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 LRRC72A6NJI9 287 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ABLIM1O14639 778 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PLD2O14939 933 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CLDN3O15551 220 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 FFAR2O15552 330 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CBFA2T2O43439 604 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TIMM44O43615 452 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CACNG3O60359 315 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 MAGEC1O60732 1142 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TCEA3O75764 348 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 FAM155BO75949 473 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 NADKO95544 446 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 OLFM2O95897 454 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 OAS1P00973 400 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 LDLRP01130 860 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 IGHDP01880 384 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 DNTTP04053 509 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CLTAP09496 248 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 GIMD1P0DJR0 217 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CXCL8P10145 99 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 C7P10643 843 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ALPPL2P10696 532 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 DGKAP23743 735 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PRKCHP24723 683 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 GUCY2CP25092 1073 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 UGT1A5P35504 534 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 FLT3P36888 993 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 MAGEA11P43364 429 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CD151P48509 253 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TAF6P49848 677 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CCR5P51681 352 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 USP46P62068 366 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 RPS14P62263 151 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ZBTB16Q05516 673 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TAF10Q12962 218 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms