RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574323.5

PHF23-209, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene PHF23, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-209ENST00000574323 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.9□□□□□ -0.02
PHF23-209ENST00000574323 PIGVQ9NUD9 493 aa14.9□□□□□ -0.02
PHF23-209ENST00000574323 PARVAQ9NVD7 372 aa14.9□□□□□ -0.02
PHF23-209ENST00000574323 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PHF23-209ENST00000574323 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 ACSL4O60488 711 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 APOEP02649 317 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 PDGFRAP16234 1089 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 SDC4P31431 198 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 CCR1P32246 355 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 OPRD1P41143 372 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 SLC11A2P49281 568 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 CLCN5P51795 746 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 GAD2Q05329 585 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 CCDC14Q49A88 953 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 RNF43Q68DV7 783 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 FBXL6Q8N531 539 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 PJA1Q8NG27 643 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 ZNF653Q96CK0 615 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 MCEEQ96PE7 176 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 FOXQ1Q9C009 403 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.89□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 CACNG3O60359 315 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 AOC1P19801 751 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 GPD1P21695 349 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 CD72P21854 359 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 NME3Q13232 169 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 FZD5Q13467 585 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 FYB2Q5VWT5 728 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 STRADAQ7RTN6 431 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 FLCNQ8NFG4 579 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 CLDN23Q96B33 292 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 CCDC42Q96M95 316 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 DEF6Q9H4E7 631 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 SCINQ9Y6U3 715 aa14.88□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 ANKRD62A6NC57 917 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 TMEM191CA6NGB0 347 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 AKR1B10O60218 316 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 CYP1A2P05177 515 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 TYRP14679 529 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 ABCB4P21439 1286 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 SLC6A4P31645 630 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 DEUP1Q05D60 604 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 CCINQ13939 588 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 ANO4Q32M45 955 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 C12orf40Q86WS4 652 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 FNIP1Q8TF40 1166 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 CD101Q93033 1021 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 EXOC4Q96A65 974 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 CNPY3Q9BT09 278 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 LRFN3Q9BTN0 628 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 BBS2Q9BXC9 721 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 THAP2Q9H0W7 228 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 ANLNQ9NQW6 1124 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 COX16Q9P0S2 106 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 FBXO10Q9UK96 956 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.87□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.86□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 FAM170BA6NMN3 283 aa14.86□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PHF23-209ENST00000574323 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms