RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 RBL1P28749 1068 aa29.42■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-210ENST00000574322 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP29.42■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-210ENST00000574322 NMUR1Q9HB89 426 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-210ENST00000574322 A6NNZ2 444 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-210ENST00000574322 RASGRF2O14827 1237 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM63AO94886 807 aa29.36■■■□□ 2.29
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