RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	IKBKB	O14920	756 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	PCDHGA12	O60330	932 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	HLA-DRA	P01903	254 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	CYBB	P04839	570 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	EPHX1	P07099	455 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	ACSL1	P33121	698 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	GRIA4	P48058	902 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	EFEMP1	Q12805	493 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	TEAD4	Q15561	434 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	CACUL1	Q86Y37	369 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	DENND1C	Q8IV53	801 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	IGSF8	Q969P0	613 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	DUSP16	Q9BY84	665 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	BACH2	Q9BYV9	841 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	CIPC	Q9C0C6	399 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	LHX5	Q9H2C1	402 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	FAM149A	A5PLN7	773 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169		E9PAM4	449 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	YEATS4	O95619	227 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	HMBS	P08397	361 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	HLA-E	P13747	358 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	PIK3CA	P42336	1068 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	GRK6	P43250	576 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	CUL4B	Q13620	913 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	SNX19	Q92543	992 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	CRELD1	Q96HD1	420 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM245	Q9H330	911 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169		H0Y8X5	98 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	PDXK	O00764	312 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	KCNK3	O14649	394 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	KLRC4	O43908	158 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	TSPAN3	O60637	253 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	KIF20A	O95235	890 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	SEMA4F	O95754	770 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	NR3C1	P04150	777 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	CD27	P26842	260 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	AFM	P43652	599 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	CCT8	P50990	548 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	PDE4C	Q08493	712 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	STK4	Q13043	487 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	DDI1	Q8WTU0	396 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	BIRC7	Q96CA5	298 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	FBRS	Q9HAH7	460 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	SLC12A8	A0AV02	714 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	MAPK13	O15264	365 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	DFNA5	O60443	496 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	HLA-F	P30511	346 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	CTSK	P43235	329 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	VAMP7	P51809	220 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	ARID5A	Q03989	594 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	ZBTB16	Q05516	673 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	GSE1	Q14687	1217 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	MPPE1	Q53F39	396 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	RAB41	Q5JT25	222 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	DHRS13	Q6UX07	377 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	LAYN	Q6UX15	382 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	ADAM32	Q8TC27	787 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	PLD4	Q96BZ4	506 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TCF4-238	ENST00000568169	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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