RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554340.1

NEMP1-204, Transcript of nuclear envelope integral membrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEMP1, Length 1,381 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP1-204ENST00000554340 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 LRMPQ12912 555 aa21.41■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 SYCP2LQ5T4T6 812 aa21.41■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 BHLHA9Q7RTU4 235 aa21.41■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 MINDY1Q8N5J2 469 aa21.41■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 NELFBQ8WX92 580 aa21.41■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 SLC2A11Q9BYW1 496 aa21.41■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa21.41■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 SUSD2Q9UGT4 822 aa21.41■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 DSPP15924 2871 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 TULP2O00295 520 aa21.4■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 SYPP08247 313 aa21.4■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 CD6P30203 668 aa21.4■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 WDR45BQ5MNZ6 344 aa21.4■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 RGL4Q8IZJ4 473 aa21.4■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 DDI1Q8WTU0 396 aa21.4■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 SCNM1Q9BWG6 230 aa21.4■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 ELOVL2Q9NXB9 296 aa21.4■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 CLEC4EQ9ULY5 219 aa21.4■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 PAEPP09466 180 aa21.39■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 SETSIPP0DME0 302 aa21.39■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 MORC3Q14149 939 aa21.39■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF234Q14588 700 aa21.39■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 TTI2Q6NXR4 508 aa21.39■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.39■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 RNF139Q8WU17 664 aa21.39■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 ITM2CQ9NQX7 267 aa21.39■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
NEMP1-204ENST00000554340 KNL1Q8NG31 2342 aa21.39■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 GNSP15586 552 aa21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 ADIGQ0VDE8 80 aa21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 PAK1Q13153 545 aa21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 STILQ15468 1287 aa21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 PLEKHG6Q3KR16 790 aa21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 TMEM270Q6UE05 265 aa21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 UBR7Q8N806 425 aa21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 OR2I1PQ8NGU4 316 aa21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa21.38■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 BIN1O00499 593 aa21.37■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 TIMM44O43615 452 aa21.37■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF445P59923 1031 aa21.37■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 MPPE1Q53F39 396 aa21.37■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 TMPRSS6Q8IU80 811 aa21.37■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.37■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 GATA6Q92908 595 aa21.37■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 CIPCQ9C0C6 399 aa21.37■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa21.37■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 TMEM8BA6NDV4 472 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 MEI4A8MW99 385 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 KCNJ18B7U540 433 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 E7ENQ6 273 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 O00370 1275 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 NCAM1P13591 858 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 CD59P13987 128 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 PRKCHP24723 683 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 OXTRP30559 389 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 TPMTP51580 245 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 COPAP53621 1224 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 SLC14A1Q13336 389 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 NUMA1Q14980 2115 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 TMEM215Q68D42 235 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 CADM4Q8NFZ8 388 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 UBA3Q8TBC4 463 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 SORCS1Q8WY21 1168 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 DNASE2BQ8WZ79 361 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 EDEM1Q92611 657 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 SIPA1Q96FS4 1042 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 GPR174Q9BXC1 333 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.36■■□□□ 1.01
NEMP1-204ENST00000554340 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms