RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	IL12RB1	P42701	662 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	GRK6	P43250	576 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	GRIA4	P48058	902 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PGF	P49763	221 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	NDST1	P52848	882 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ZNF445	P59923	1031 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ARID5A	Q03989	594 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ZBTB16	Q05516	673 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CYP4F3	Q08477	520 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	STIM1	Q13586	685 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	NFKBIB	Q15653	356 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CPXM2	Q8N436	756 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	OR2T3	Q8NH03	318 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	IGSF8	Q969P0	613 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TSG101	Q99816	390 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	IL21R	Q9HBE5	538 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CD93	Q9NPY3	652 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	OSER1	Q9NX31	292 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PLK2	Q9NYY3	685 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	NAGPA	Q9UK23	515 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PTPRD	P23468	1912 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	IGF2R	P11717	2491 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CACNA1E	Q15878	2313 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688		A0A1B0GVT2	93 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PQH9	124 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SYCE3	A1L190	88 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	KCNJ18	B7U540	433 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	HHLA1	C9JL84	531 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PDXK	O00764	312 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CYP26A1	O43174	497 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	KIF20A	O95235	890 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	KLKB1	P03952	638 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	EPHX1	P07099	455 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	C1S	P09871	688 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	HLA-E	P13747	358 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CD27	P26842	260 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ADORA2B	P29275	332 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	HNF1B	P35680	557 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ABCG1	P45844	678 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CCT8	P50990	548 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	KIF11	P52732	1056 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	COPA	P53621	1224 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	BNC1	Q01954	994 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	INCA1	Q0VD86	236 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PAK1	Q13153	545 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ADAM9	Q13443	819 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CAMK2B	Q13554	666 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ZNF234	Q14588	700 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PTPRN	Q16849	979 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	GEN1	Q17RS7	908 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	KIF19	Q2TAC6	998 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ZACN	Q401N2	412 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	MPPE1	Q53F39	396 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TTC39C	Q8N584	583 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	C12orf29	Q8N999	325 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TMC2	Q8TDI7	906 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	GOLGA1	Q92805	767 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	BHMT	Q93088	406 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SKA1	Q96BD8	255 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	DUSP16	Q9BY84	665 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CIPC	Q9C0C6	399 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		7.17	□□□□□ -1.26

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