RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 EXD3Q8N9H8 876 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 KCNE4Q8WWG9 221 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 AK8Q96MA6 479 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 SDCBP2Q9H190 292 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 PRSS16Q9NQE7 514 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 COMMD8Q9NX08 183 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 RELNP78509 3460 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 C10orf142B7Z368 130 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 SLC26A4O43511 780 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 HMBSP08397 361 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 RARGP13631 454 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 MAP3K7CLP57077 242 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 MYL6P60660 151 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 TNNC1P63316 161 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 GABREP78334 506 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 ILKQ13418 452 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 PROX2Q3B8N5 592 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 SCD5Q86SK9 330 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 WDR49Q8IV35 697 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 ZNF516Q92618 1163 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 JAKMIP2Q96AA8 810 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 ASCL3Q9NQ33 180 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 HHLA1C9JL84 531 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 TRIM38O00635 465 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 FAM163BP0C2L3 166 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 ACP1P24666 158 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 PLA2G4AP47712 749 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 GALCP54803 685 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 MCTP1Q6DN14 999 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 NCEH1Q6PIU2 408 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 ACOT1Q86TX2 421 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 SGK2Q9HBY8 427 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 SCML2Q9UQR0 700 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 ATP8B3O60423 1300 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 ZNF233A6NK53 670 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 K7ENP7 123 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 SDC3O75056 442 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 DXOO77932 396 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 DNTTP04053 509 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 CD38P28907 300 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 HLA-FP30511 346 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 HOXD13P35453 343 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 NXPH1P58417 271 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 RDH13Q8NBN7 331 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 EPSTI1Q96J88 318 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 GDF3Q9NR23 364 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 SIGLEC6O43699 453 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 USP12O75317 370 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 MYF5P13349 255 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 LINC00303Q3SY05 128 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 KLHDC10Q6PID8 442 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 ADIPOR2Q86V24 386 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 DENND1CQ8IV53 801 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 C12orf29Q8N999 325 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 HPS3Q969F9 1004 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 CGRRF1Q99675 332 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-230ENST00000551968 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms