RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 LINC01565O15544 149 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TADA3O75528 432 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 FTCDO95954 541 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CHKAP35790 457 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ARL4AP40617 200 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TFDP2Q14188 446 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 KRT81Q14533 505 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TEAD2Q15562 447 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 DPYSL2Q16555 572 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SEL1L2Q5TEA6 688 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 HTR3DQ70Z44 454 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 MTSS1LQ765P7 747 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 FAM71BQ8TC56 605 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ATRIPQ8WXE1 791 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SMARCD2Q92925 531 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 HLA-CQ95604 372 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TLR10Q9BXR5 811 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TKTL2Q9H0I9 626 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TRPV4Q9HBA0 871 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 HOMER3Q9NSC5 361 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 MTMR10Q9NXD2 777 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 PCSK1NQ9UHG2 260 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 STOML2Q9UJZ1 356 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CDH7Q9ULB5 785 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 FZD10Q9ULW2 581 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SNX12Q9UMY4 172 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 AP4E1Q9UPM8 1137 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 DENND4AQ7Z401 1863 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 LRRD1A4D1F6 860 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 H3BRJ5 948 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 KCNK3O14649 394 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ACSL4O60488 711 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TBX10O75333 385 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 MOSPD3O75425 235 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TJP3O95049 919 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 RARAP10276 462 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 PTPN7P35236 360 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 LTBRP36941 435 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 PAFAH1B1P43034 410 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 PEX5P50542 639 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CYP4F8P98187 520 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 PPP2R5EQ16537 467 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 AAK1Q2M2I8 961 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SLC5A9Q2M3M2 681 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TFDP3Q5H9I0 405 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 RABGAP1LQ5R372 815 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ADGRF1Q5T601 910 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SYT10Q6XYQ8 523 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 FAM131BQ86XD5 332 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CPXM2Q8N436 756 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ADAM32Q8TC27 787 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 MYLIPQ8WY64 445 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SUSD6Q92537 303 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 FGF13Q92913 245 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 NXPE3Q969Y0 559 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 FAM161BQ96MY7 647 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ZNF670Q9BS34 389 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 RNF38Q9H0F5 515 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 COX16Q9P0S2 106 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 OR12D3Q9UGF7 316 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 NR2E1Q9Y466 385 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 RAD54BQ9Y620 910 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CPQQ9Y646 472 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-220ENST00000550700 F5H5T6 163 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-220ENST00000550700 LEFTY2O00292 366 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-220ENST00000550700 DAPK3O43293 454 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-220ENST00000550700 MSI1O43347 362 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-220ENST00000550700 PAGE1O75459 146 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-220ENST00000550700 STC2O76061 302 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms