RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 ACOX2Q99424 681 aa18.46■□□□□ 0.55
CS-219ENST00000550655 HINFPQ9BQA5 517 aa18.46■□□□□ 0.55
CS-219ENST00000550655 BPIFA3Q9BQP9 254 aa18.46■□□□□ 0.55
CS-219ENST00000550655 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CS-219ENST00000550655 ASNSD1Q9NWL6 643 aa18.46■□□□□ 0.55
CS-219ENST00000550655 RAB23Q9ULC3 237 aa18.46■□□□□ 0.55
CS-219ENST00000550655 TLR6Q9Y2C9 796 aa18.46■□□□□ 0.55
CS-219ENST00000550655 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 LRRC10BA6NIK2 292 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 IRAK2O43187 625 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ACSL4O60488 711 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 TSPAN3O60637 253 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 GLI1P08151 1106 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ATP1A3P13637 1013 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 SLC6A4P31645 630 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ZNF445P59923 1031 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 SYCP1Q15431 976 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 RNF43Q68DV7 783 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 CEP68Q76N32 757 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 UNC45BQ8IWX7 931 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 DDI1Q8WTU0 396 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 AZIN2Q96A70 460 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 NOX5Q96PH1 765 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 SLC2A13Q96QE2 648 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 FUCA2Q9BTY2 467 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 TPSD1Q9BZJ3 242 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 CD248Q9HCU0 757 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 CAPN9O14815 690 aa18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 TGM1P22735 817 aa18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 NTSR1P30989 418 aa18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 TAF3Q5VWG9 929 aa18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 RFWD3Q6PCD5 774 aa18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 KBTBD6Q86V97 674 aa18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 TMEM35BQ8NCS4 154 aa18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 SLC2A11Q9BYW1 496 aa18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 GMEB2Q9UKD1 530 aa18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 CEP83Q9Y592 693 aa18.44■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 THADAQ6YHU6 1953 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 A0A1W2PQF6 199 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 HSF2BPO75031 334 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 DAB1O75553 588 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 HOXB2P14652 356 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 WASP42768 502 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 SLC11A2P49281 568 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 KLHL40Q2TBA0 621 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 EFHC1Q5JVL4 640 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 PIK3R6Q5UE93 754 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 TMEM215Q68D42 235 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 OR6B2Q6IFH4 312 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 SLC26A9Q7LBE3 791 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 KIAA2013Q8IYS2 634 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 DEFB106AQ8N104 65 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 OLIG1Q8TAK6 271 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 SLC20A1Q8WUM9 679 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 MYEOVQ96EZ4 313 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ERGIC2Q96RQ1 377 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 GABRG3Q99928 467 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 PARD6AQ9NPB6 346 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 NLRC4Q9NPP4 1024 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 NUP205Q92621 2012 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 CEP192Q8TEP8 1941 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 DCLK1O15075 740 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 GRAP2O75791 330 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ALDH1A2O94788 518 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 GFPT2O94808 682 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 LSM8O95777 96 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 RETP07949 1114 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 MMEP08473 750 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 HLA-FP30511 346 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 SOX5P35711 763 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 GABRB2P47870 512 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 NOMO3P69849 1222 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 SLC6A3Q01959 620 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 UBXN1Q04323 297 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 DCAF6Q58WW2 860 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 CHPFQ8IZ52 775 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 WFDC5Q8TCV5 224 aa18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms