RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542555.1

CLPB-211, Transcript of ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin, humanhuman

TSL 2

Gene CLPB, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPB-211ENST00000542555 EML5Q05BV3 1969 aa8.52□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 TRIP11Q15643 1979 aa8.52□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 CITO14578 2027 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 IGF2RP11717 2491 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 TBC1D3BA6NDS4 549 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 KPNA7A9QM74 516 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 E9PMD0 336 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 ABLIM1O14639 778 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 KAT7O95251 611 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 NEFLP07196 543 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 TCF3P15923 654 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 GUCY2CP25092 1073 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 ANXA13P27216 316 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 FAM193AP78312 1265 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 DDR2Q16832 855 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 TTC38Q5R3I4 469 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 RINT1Q6NUQ1 792 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 IL27RAQ6UWB1 636 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 TMEM150AQ86TG1 271 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 DEFB119Q8N690 84 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 IL17RCQ8NAC3 791 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 CAMK1GQ96NX5 476 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 ASB7Q9H672 318 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 CAPN10Q9HC96 672 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 ABCB6Q9NP58 842 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 DPP3Q9NY33 737 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 DKK4Q9UBT3 224 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.51□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 MEI4A8MW99 385 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 SGK1O00141 431 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 PIRO00625 290 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 RRP8O43159 456 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 NOL4O94818 638 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 CER1O95813 267 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 ABL1P00519 1130 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 CAPNS1P04632 268 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 HOXB2P14652 356 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 PCSK1P29120 753 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 OPRD1P41143 372 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 TNFSF9P41273 254 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 PPP3CCP48454 512 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 GAD2Q05329 585 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 CYP4F3Q08477 520 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 ECM1Q16610 540 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 WSCD1Q658N2 575 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 GLRX5Q86SX6 157 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 C1QL4Q86Z23 238 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 DAW1Q8N136 415 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 ACBD6Q9BR61 282 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 LINC00597Q9H2U6 94 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 KCND2Q9NZV8 630 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 ANO9A1A5B4 782 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 E9PAM4 449 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 LEFTY2O00292 366 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 PPEF2O14830 753 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 KRT18P05783 430 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 GLI1P08151 1106 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 NTSR1P30989 418 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 TRAPPC10P48553 1259 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 GPR15P49685 360 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 KDSRQ06136 332 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 DHCR24Q15392 516 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 SDHAF4Q5VUM1 108 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 C1orf186Q6ZWK4 172 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 LRRTM3Q86VH5 581 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 FRMD1Q8N878 549 aa8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CLPB-211ENST00000542555 OR2I1PQ8NGU4 316 aa8.49□□□□□ -1.05
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