RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535811.1

PARPBP-208, Transcript of PARP1 binding protein, human

TSL 2

Gene PARPBP, Length 1,465 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARPBP-208	ENST00000535811	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	GAB1	Q13480	694 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	NCK2	O43639	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811		M0QZQ0	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	MYL1	P05976	194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TFEB	P19484	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	MTX1	Q13505	466 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	STIM1	Q13586	685 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	PCDH17	O14917	1159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	NPC1	O15118	1278 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	OAZ2	O95190	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	NTSR2	O95665	410 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	FGF2	P09038	288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	GSTM5	P46439	218 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	AK2	P54819	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	BFSP2	Q13515	415 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	PIGK	Q92643	395 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	PMM1	Q92871	262 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	PLIN1	O60240	522 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	PLA2G6	O60733	806 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	ITGA5	P08648	1049 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	SLC8A1	P32418	973 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	STAT6	P42226	847 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	CPA2	P48052	419 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	ME1	P48163	572 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	HSPA7	P48741	367 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	LINC00205	P59089	165 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	ELF2	Q15723	593 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811		A0A0G2JK05	382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	MYMK	A6NI61	221 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811		F8W810	466 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	PODXL	O00592	558 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	TRIM38	O00635	465 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	INSIG1	O15503	277 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	TULP3	O75386	442 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	IGFBP2	P18065	325 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	YY1	P25490	414 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARPBP-208	ENST00000535811	VPS41	P49754	854 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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