RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534401.5

PKP3-211, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 756 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-211ENST00000534401 UNGP13051 313 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 MMP8P22894 467 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 FANCCQ00597 558 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 MPPE1Q53F39 396 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 FIGNQ5HY92 759 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 MPP7Q5T2T1 576 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 NADSYN1Q6IA69 706 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 CAMKK1Q8N5S9 505 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 IL17RCQ8NAC3 791 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 R4GN57 208 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 EML5Q05BV3 1969 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 DMDP11532 3685 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
PKP3-211ENST00000534401 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 HOXC13P31276 330 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 NOS2P35228 1153 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 CDK17Q00537 523 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 KDSRQ06136 332 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 PTP4A2Q12974 167 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 NFKBIBQ15653 356 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 DCAF6Q58WW2 860 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 EMC10Q5UCC4 262 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 PIK3R6Q5UE93 754 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 NPY6RQ99463 290 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 RRN3Q9NYV6 651 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 PLK2Q9NYY3 685 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 TMEM59LQ9UK28 342 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 KCNU1A8MYU2 1149 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 PRRT4C9JH25 899 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 CYBBP04839 570 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 FERP16591 822 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 SLC6A4P31645 630 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 MATKP42679 507 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 SLC11A2P49281 568 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 DGKGP49619 791 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 MRE11P49959 708 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 DMWDQ09019 674 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 DMC1Q14565 340 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 NAA35Q5VZE5 725 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 BNIPLQ7Z465 357 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 WDR5BQ86VZ2 330 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 ADAM32Q8TC27 787 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 EBF1Q9UH73 591 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 CLEC4EQ9ULY5 219 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 PRR23AA6NEV1 266 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 GRAP2O75791 330 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 GSCP56915 257 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 TPM4P67936 248 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 CENPCQ03188 943 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 C2orf27AQ580R0 203 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 LONP2Q86WA8 852 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 MSANTD4Q8NCY6 345 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 SYNCQ9H7C4 482 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 TMEM51Q9NW97 253 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 USP34Q70CQ2 3546 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 ADAM23O75077 832 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 SERPINC1P01008 464 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 CNR2P34972 360 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 SEC13P55735 322 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 LMLNQ96KR4 655 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 BTN2A3PQ96KV6 586 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 AGPAT1Q99943 283 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 EPC1Q9H2F5 836 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 CD248Q9HCU0 757 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 ZNF292O60281 2723 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 CCDC172P0C7W6 258 aa22.16■■□□□ 1.14
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