RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529766.5

BBS1-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5

Gene BBS1, Length 1,590 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-215	ENST00000529766	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	APOC2	P02655	101 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	POU2F2	P09086	479 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	PTGIR	P43119	386 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	EPHA5	P54756	1037 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TBX4	P57082	545 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ELF2	Q15723	593 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	FAM72B	Q86X60	149 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	PLD5	Q8N7P1	536 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TTC13	Q8NBP0	860 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	EPC1	Q9H2F5	836 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	AMACR	Q9UHK6	382 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	EPOP	A6NHQ4	379 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	COCH	O43405	550 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	RAD51C	O43502	376 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	LIAS	O43766	372 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	PAGE1	O75459	146 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	OLFM2	O95897	454 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	GOT1	P17174	413 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ARL4A	P40617	200 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	MTA1	Q13330	715 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	DPYS	Q14117	519 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	C8orf74	Q6P047	294 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	GAREM2	Q75VX8	874 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	RFX6	Q8HWS3	928 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	RNF34	Q969K3	372 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	RNF38	Q9H0F5	515 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	CERS4	Q9HA82	394 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	DPP7	Q9UHL4	492 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766		H3BRJ5	948 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TUBB	P07437	444 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	EPCAM	P16422	314 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TGM2	P21980	687 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	HTR7	P34969	479 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	KCNC3	Q14003	757 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	RFX8	Q6ZV50	586 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ATL2	Q8NHH9	583 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ACTL9	Q8TC94	416 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	SEC14L1	Q92503	715 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	RUBCN	Q92622	972 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	RAB21	Q9UL25	225 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TRANK1	O15050	2925 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	SLC12A8	A0AV02	714 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	C2orf78	A6NCI8	922 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	FAM187A	A6NFU0	413 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	APOL1	O14791	398 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	PER2	O15055	1255 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	CSPG5	O95196	566 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	PFKL	P17858	780 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	AMPD1	P23109	780 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	HOXC13	P31276	330 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	KCNJ1	P48048	391 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	NR2C2	P49116	596 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	COG7	P83436	770 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	DR1	Q01658	176 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	NOMO1	Q15155	1222 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	DUSP6	Q16828	381 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	WDR93	Q6P2C0	686 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	MIB1	Q86YT6	1006 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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