RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 TDP1Q9NUW8 608 aa23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNU1A8MYU2 1149 aa23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 LEFTY2O00292 366 aa23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 IGLV3-27P01718 113 aa23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 ADRA1BP35368 520 aa23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 MTHFRP42898 656 aa23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 COG7P83436 770 aa23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 AADACL2Q6P093 401 aa23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 CDH7Q9ULB5 785 aa23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 PAGE1O75459 146 aa23.59■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 CD48P09326 243 aa23.59■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 CXCR5P32302 372 aa23.59■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 ETF1P62495 437 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 HADHQ16836 314 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 RAPGEF5Q92565 580 aa23.59■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 FZD10Q9ULW2 581 aa23.59■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa23.59■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM72CH0Y354 149 aa23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 MBTPS2O43462 519 aa23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 GREM1O60565 184 aa23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM72AQ5TYM5 149 aa23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM72DQ6L9T8 149 aa23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM72BQ86X60 149 aa23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 RHOT1Q8IXI2 618 aa23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF592Q92610 1267 aa23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 HES6Q96HZ4 224 aa23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.371e-6■■■■□ 19.5
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 LCMT1Q9UIC8 334 aa23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 AP4E1Q9UPM8 1137 aa23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-208ENST00000524325 ERMARDQ5T6L9 678 aa23.58■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa23.58■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 ASB16Q96NS5 453 aa23.58■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 APOEP02649 317 aa23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 HARS2P49590 506 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 PEX5P50542 639 aa23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 NNTQ13423 1086 aa23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP2R5DQ14738 602 aa23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 RPS6KA1Q15418 735 aa23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 PIK3R6Q5UE93 754 aa23.57■■□□□ 1.36
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TSNARE1-208ENST00000524325 MYEOVQ96EZ4 313 aa23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 JRKLQ9Y4A0 524 aa23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa23.57■■□□□ 1.36
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TSNARE1-208ENST00000524325 C14orf80Q86SX3 495 aa23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 SMARCD2Q92925 531 aa23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 GDE1Q9NZC3 331 aa23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 HS3ST4Q9Y661 456 aa23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 SRGAP2O75044 1071 aa23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT1P04264 644 aa23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 RING1Q06587 406 aa23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 MMRN1Q13201 1228 aa23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 BRMS1LQ5PSV4 323 aa23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 RAP1GAP2Q684P5 730 aa23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 RFWD3Q6PCD5 774 aa23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 BBS7Q8IWZ6 715 aa23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 PLD4Q96BZ4 506 aa23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 OBSL1O75147 1896 aa23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRD1A4D1F6 860 aa23.55■■□□□ 1.36
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TSNARE1-208ENST00000524325 CTNNA2P26232 953 aa23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 ARL13BQ3SXY8 428 aa23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 BOLA3Q53S33 107 aa23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 EFHC2Q5JST6 749 aa23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 NUGGCQ68CJ6 796 aa23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 PARM1Q6UWI2 310 aa23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 KCTD6Q8NC69 237 aa23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 NECTIN4Q96NY8 510 aa23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNK3O14649 394 aa23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 PSTPIP1O43586 416 aa23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 CREB3O43889 395 aa23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT7P08729 469 aa23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 PYGMP11217 842 aa23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 PFKLP17858 780 aa23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 FCARP24071 287 aa23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC6A4P31645 630 aa23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 CDH6P55285 790 aa23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 MS4A13Q5J8X5 152 aa23.54■■□□□ 1.36
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