RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABHD10Q9NUJ1 306 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM49BQ9NUQ9 324 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF69Q9UC07 566 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLHL3Q9UH77 587 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 LZTS1Q9Y250 596 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDY1Q9Y6F8 540 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SIP14410 1827 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 C2orf71A6NGG8 1288 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMCO5BA8MYB1 307 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 O00370 1275 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 FSCN2O14926 492 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MED7O43513 233 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SOAT2O75908 522 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 BEST1O76090 585 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SEC24AO95486 1093 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 VNN2O95498 520 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 FTLP02792 175 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 URODP06132 367 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 EPHX1P07099 455 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ELF1P32519 619 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 GRIK1P39086 918 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRKCIP41743 596 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAGEA1P43355 309 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAP3K7CLP57077 242 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDK17Q00537 523 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 FMO1Q01740 532 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDR2Q01850 454 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ROR1Q01973 937 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 GTF2H3Q13889 308 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC122Q5T0U0 273 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 C6orf118Q5T5N4 469 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SDHAF4Q5VUM1 108 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLPP4Q5VZY2 271 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARHGAP17Q68EM7 881 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC8B1Q6J4K2 584 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF280DQ6N043 979 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 LILRA6Q6PI73 481 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 LCLAT1Q6UWP7 414 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 HFE2Q6ZVN8 426 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 FGD2Q7Z6J4 655 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 DNAAF5Q86Y56 855 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SCN4BQ8IWT1 228 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 GPR65Q8IYL9 337 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 FUKQ8N0W3 1084 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF461Q8TAF7 563 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PTPRN2Q92932 1015 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPP1R14AQ96A00 147 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MYLPFQ96A32 169 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PCED1BQ96HM7 432 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 KCNK16Q96T55 309 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PKMYT1Q99640 499 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SMOQ99835 787 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 DUSP16Q9BY84 665 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZBP1Q9H171 429 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRDM12Q9H4Q4 367 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGFLR1Q9H665 355 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 TLE6Q9H808 572 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 TLR9Q9NR96 1032 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 FNIP2Q9P278 1114 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MTRRQ9UBK8 725 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 STK39Q9UEW8 545 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CITO14578 2027 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MICAL3Q7RTP6 2002 aa5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A087X0T9 212 aa5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A1W2PPC1 479 aa5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 WDR27A2RRH5 827 aa5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 TULP2O00295 520 aa5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PIK3R2O00459 728 aa5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 TGM5O43548 720 aa5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 AKR1B10O60218 316 aa5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 RTN2O75298 545 aa5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PGRP06401 933 aa5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM228BP0C875 321 aa5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms