RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 WNT16Q9UBV4 365 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 CKAP5Q14008 2032 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRYO14603 147 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF432O94892 652 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 AKR1A1P14550 325 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL1R1P14778 569 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 DRD1P21728 446 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 NDUFS1P28331 727 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 DUSP1P28562 367 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 HTR7P34969 479 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOXD12P35452 270 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 CARSP49589 748 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 APOA5Q6Q788 366 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 UNC13DQ70J99 1090 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRILQ7L0X0 811 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZDHHC12Q96GR4 267 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 ELOVL1Q9BW60 279 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLK2Q9NYY3 685 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC8A2Q9UPR5 921 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 COL15A1P39059 1388 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 EMSYQ7Z589 1322 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 CPA1P15085 419 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 PBX1P40424 430 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 SOX2P48431 317 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 DSCR9P59020 149 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTAPQ13126 283 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAB1Q13480 694 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 WASHC2DQ5SRD0 308 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC25A32Q9H2D1 315 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF287Q9HBT7 754 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBC1D23Q9NUY8 699 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF212Q9UDV6 495 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 E2F8A0AVK6 867 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALDH1L1O75891 902 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 RFX2P48378 723 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 COMPP49747 757 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 HILS1P60008 231 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 FMO1Q01740 532 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 PGM5Q15124 567 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 ISM2Q6H9L7 571 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 HMBOX1Q6NT76 420 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRIG3Q6UXM1 1119 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 RHPN2Q8IUC4 686 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDIASQ8IXT1 998 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 C7orf57Q8NEG2 295 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 LMO3Q8TAP4 145 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 WBP1Q96G27 269 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 TM6SF1Q9BZW5 370 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM60Q9H2L4 133 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 TASP1Q9H6P5 420 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 RMI1Q9H9A7 625 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 COL20A1Q9P218 1284 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 DOCK7Q96N67 2140 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A087WYN8 130 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 RHODO00212 210 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 PODXLO00592 558 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 ENO1P06733 434 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 MATN1P21941 496 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC8A1P32418 973 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCYT1AP49585 367 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACOX1Q15067 660 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP4R4Q6NUP7 873 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXL22Q6P050 247 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 GJA10Q969M2 543 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 SELENOOQ9BVL4 669 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC27Q9C0I9 530 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 ISCUQ9H1K1 167 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDT1Q9H211 546 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 LAMP3Q9UQV4 416 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCN5AQ14524 2016 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 FRS3O43559 492 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 LDB3O75112 727 aa3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms