RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 VWC2LB2RUY7 222 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 LPXNO60711 386 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 F9P00740 461 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 C8AP07357 584 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 CHMP24386 653 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 PCP4P48539 62 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 POLD2P49005 469 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 E2F1Q01094 437 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 TLE3Q04726 772 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 DNASE1L3Q13609 305 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 TP53BP2Q13625 1128 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 BRINP3Q76B58 766 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 LNX2Q8N448 690 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF276Q8N554 614 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM200CA6NKL6 621 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 ONECUT2O95948 504 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 ITGB3P05106 788 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 WEE2P0C1S8 567 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 PAFAH1B1P43034 410 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 TDGQ13569 410 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 MEA1Q16626 185 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM69AQ5T7M9 428 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 TMTC3Q6ZXV5 915 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 MYEOVQ96EZ4 313 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 PGBD1Q96JS3 809 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 SDF4Q9BRK5 362 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 ALG8Q9BVK2 526 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 CLPBQ9H078 707 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 PDE11AQ9HCR9 933 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 KLC4Q9NSK0 619 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 AP4M1O00189 453 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 GRM8O00222 908 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 GUCY1B2O75343 617 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 LAG3P18627 525 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 CTGFP29279 349 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 CXCR5P32302 372 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 TPTEP56180 551 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 GUCY1B3Q02153 619 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 NUCB1Q02818 461 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 GLMPQ8WWB7 406 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 MASTLQ96GX5 879 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 TEPSINQ96N21 525 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 EHD3Q9NZN3 535 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR34Q9UPC5 381 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 CAMK2AQ9UQM7 478 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-205ENST00000514178 H3BNC9 293 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 CES2O00748 559 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 TMPRSS11DO60235 418 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 DOK2O60496 412 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 NXPH3O95157 252 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 CHRM2P08172 466 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 TNNT1P13805 278 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 RPS6KB1P23443 525 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 PDE1AP54750 535 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC25A3Q00325 362 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 SEC23BQ15437 767 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR93Q6P2C0 686 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF585AQ6P3V2 769 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 SIRT6Q8N6T7 355 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 SERINC2Q96SA4 455 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 CENPOQ9BU64 300 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 USP44Q9H0E7 712 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 DEF6Q9H4E7 631 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 MROH8Q9H579 483 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 CEP72Q9P209 647 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-205ENST00000514178 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms