RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC36A4Q6YBV0 504 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SHC3Q92529 594 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDST4Q9H3R1 872 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LMBRD1Q9NUN5 540 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ELOVL2Q9NXB9 296 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 DPP6P42658 865 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIAA1211LQ6NV74 962 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACSL4O60488 711 aa17.51■□□□□ 0.39
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF43Q68DV7 783 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP2U1Q7Z449 544 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FRMD1Q8N878 549 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM149B1Q96BN6 582 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMOC1Q9H4F8 434 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POPDC2Q9HBU9 364 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIX2Q9NPC8 291 aa17.51■□□□□ 0.39
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 RXFP3Q9NSD7 469 aa17.51■□□□□ 0.39
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAPN9O14815 690 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TM4SF5O14894 197 aa17.5■□□□□ 0.39
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDUFV2P19404 249 aa17.5■□□□□ 0.39
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 APBA1Q02410 837 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MIIPQ5JXC2 388 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STPG1Q5TH74 334 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM215Q68D42 235 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL31Q6EBC2 164 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEFF1Q8IYR6 380 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDTC1Q8N5D0 677 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP17.5■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC39A13Q96H72 371 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRGPRX1Q96LB2 322 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAD54BQ9Y620 910 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUP205Q92621 2012 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 E5RJQ4 531 aa17.49■□□□□ 0.39
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GLI1P08151 1106 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HOXD12P35452 270 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL12RB1P42701 662 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNX16P57768 344 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BPIFB4P59827 614 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDCLQ13371 301 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF234Q14588 700 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYPL2Q5VXT5 272 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYT12Q8IV01 421 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIGKQ92643 395 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CIPCQ9C0C6 399 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASNSD1Q9NWL6 643 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLA2G4CQ9UP65 541 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC6A4P31645 630 aa17.48■□□□□ 0.39
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