RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 FIZ1Q96SL8 496 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 STRA6Q9BX79 667 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 MSRAQ9UJ68 235 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 TET1Q8NFU7 2136 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 MROH7Q68CQ1 1323 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 A0A087WZ62 844 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 TRIM49BA6NDI0 452 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ACKR2O00590 384 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 CLIC2O15247 247 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 CLDN3O15551 220 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 CAND2O75155 1236 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ADCY5O95622 1261 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 VTNP04004 478 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ZNF18P17022 549 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 AXLP30530 894 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 CYP2J2P51589 502 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 FPGSQ05932 587 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 PTGISQ16647 500 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 MARCH8Q5T0T0 291 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ZNF605Q86T29 641 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 LINC01465Q8N7H1 131 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 TMEM174Q8WUU8 243 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 DNAJB3Q8WWF6 145 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ADPGKQ9BRR6 497 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 KIFC3Q9BVG8 833 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 IFNKQ9P0W0 207 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 GINS2Q9Y248 185 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
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HERC3-210ENST00000512194 TOM1L1O75674 476 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 PIGRP01833 764 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 MYBL2P10244 700 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 HOXC8P31273 242 aa7.83□□□□□ -1.16
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HERC3-210ENST00000512194 GPC3P51654 580 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 ZNF75DP51815 510 aa7.83□□□□□ -1.16
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HERC3-210ENST00000512194 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 ENPEPQ07075 957 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 DRP2Q13474 957 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 PDCD1Q15116 288 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 SURF1Q15526 300 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 MAN2A1Q16706 1144 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 PTPN21Q16825 1174 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 FAM187BQ17R55 369 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 TMEM240Q5SV17 173 aa7.83□□□□□ -1.16
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HERC3-210ENST00000512194 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 RPAINQ86UA6 219 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 PROSER1Q86XN7 944 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 CILP2Q8IUL8 1156 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 HACE1Q8IYU2 909 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 IQCDQ96DY2 449 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 FOXB1Q99853 325 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 WNT8AQ9H1J5 351 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 FZD8Q9H461 694 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 TRPV2Q9Y5S1 764 aa7.83□□□□□ -1.16
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