RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RFX6	Q8HWS3	928 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	OPTN	Q96CV9	577 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM20A	Q96MK3	541 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SPX	Q9BT56	116 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	NUF2	Q9BZD4	464 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RAB34	Q9BZG1	259 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	OR10A4	Q9H209	315 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	MARK1	Q9P0L2	795 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	FETUB	Q9UGM5	382 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CSAD	Q9Y600	493 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RLF	Q13129	1914 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM247	A6NEH6	219 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF879	B4DU55	563 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	GOLGA8R	I6L899	631 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TSPAN9	O75954	239 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	HLA-DRA	P01903	254 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	STAT5B	P51692	787 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ARL4C	P56559	192 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	GMFB	P60983	142 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ASPH	Q12797	758 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	VGLL4	Q14135	290 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	GALE	Q14376	348 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	DHCR24	Q15392	516 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TEAD4	Q15561	434 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CALCRL	Q16602	461 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	UBE2S	Q16763	222 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RGS21	Q2M5E4	152 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	UBXN11	Q5T124	520 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	USP49	Q70CQ1	688 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM124A	Q86V42	546 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	REPS2	Q8NFH8	660 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	OR6S1	Q8NH40	331 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF653	Q96CK0	615 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRC39	Q96DD0	335 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CABS1	Q96KC9	395 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNK13	Q9HB14	408 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	C8orf4	Q9NR00	106 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RPTOR	Q8N122	1335 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	OTOF	Q9HC10	1997 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PTPRF	P10586	1907 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	OR5K4	A6NMS3	321 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ADM5	C9JUS6	153 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	HDAC3	O15379	428 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC37A4	O43826	429 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PEX1	O43933	1283 aa		7	□□□□□ -1.29

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