RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-215ENST00000498284 WIPF3A6NGB9 483 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 TTC34A8MYJ7 566 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-215ENST00000498284 FAM90A14PP0C7W9 464 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-215ENST00000498284 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-215ENST00000498284 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-215ENST00000498284 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-215ENST00000498284 LATS1O95835 1130 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRK-215ENST00000498284 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF569Q5MCW4 686 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 NFRKBQ6P4R8 1299 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 RAB11FIP2Q7L804 512 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRK-215ENST00000498284 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRK-215ENST00000498284 MAFFQ9ULX9 164 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 C16orf96A6NNT2 1141 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 EFCAB8A8MWE9 144 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRK-215ENST00000498284 PRYO14603 147 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRK-215ENST00000498284 LARGE1O95461 756 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 NDUFS1P28331 727 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 HALP42357 657 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 VPS41P49754 854 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 PRKG1Q13976 671 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 TIGD6Q17RP2 521 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRK-215ENST00000498284 VPS16Q9H269 839 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-215ENST00000498284 ASNSD1Q9NWL6 643 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRK-215ENST00000498284 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-215ENST00000498284 RPL15P61313 204 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-215ENST00000498284 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-215ENST00000498284 TLE3Q04726 772 aa5.02□□□□□ -1.61
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