RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF487	B1APH4	448 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TTI1	O43156	1089 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF623	O75123	536 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CABYR	O75952	493 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	LRIG2	O94898	1065 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	EOMES	O95936	686 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ERBB2	P04626	1255 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	KRT19	P08727	400 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	RARB	P10826	455 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CD58	P19256	250 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	SPINK2	P20155	84 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	FGFR4	P22455	802 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	PCK1	P35558	622 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	PSMC4	P43686	418 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TAS2R40	P59535	323 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	BEX3	Q00994	111 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	DR1	Q01658	176 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	OGDH	Q02218	1023 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	PDCL	Q13371	301 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TTC27	Q6P3X3	843 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM110	Q86TL2	294 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	RSPH3	Q86UC2	560 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ERICH1	Q86X53	443 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	PASD1	Q8IV76	773 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	C7orf31	Q8N865	590 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	KCT2	Q8NC54	265 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC45	Q96CN5	670 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	C18orf8	Q96DM3	657 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF560	Q96MR9	790 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CPXM1	Q96SM3	734 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	MIPEP	Q99797	713 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	PIF1	Q9H611	641 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	AMACR	Q9UHK6	382 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	NFU1	Q9UMS0	254 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	IPP	Q9Y573	584 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	GRIN2D	O15399	1336 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ESYT3	A0FGR9	886 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247		H0YGN5	161 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	PTGES	O14684	152 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	GABRD	O14764	452 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	PPEF2	O14830	753 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TP73	O15350	636 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	PPFIA2	O75334	1257 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ENDOD1	O94919	500 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	PFKM	P08237	780 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	KRT7	P08729	469 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM153B	P0C7A2	387 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CD19	P15391	556 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	IVD	P26440	423 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	GRIK1	P39086	918 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CETN2	P41208	172 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	RAP1GAP	P47736	663 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB27A	P51159	221 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	GUCY2F	P51841	1108 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	NDST1	P52848	882 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CDH8	P55286	799 aa		5.81	□□□□□ -1.48

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