RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485604.1

PHF20-212, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene PHF20, Length 446 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-212ENST00000485604 PKDCCQ504Y2 493 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 C2orf27AQ580R0 203 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 C10orf76Q5T2E6 689 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 FYB2Q5VWT5 728 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 PM20D1Q6GTS8 502 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 ANO7Q6IWH7 933 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TTI2Q6NXR4 508 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 PIGZQ86VD9 579 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 C11orf74Q86VG3 221 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TMEM25Q86YD3 366 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TTC39CQ8N584 583 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 FBXL13Q8NEE6 735 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TTC16Q8NEE8 873 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 LMO3Q8TAP4 145 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 EEF2KMTQ96G04 330 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 GSDMAQ96QA5 445 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 ZSWIM1Q9BR11 485 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 MED10Q9BTT4 135 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TPSD1Q9BZJ3 242 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 UBXN6Q9BZV1 441 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 IMPG2Q9BZV3 1241 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 PRORYQ9H606 182 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 RAB20Q9NX57 234 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 STOML2Q9UJZ1 356 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 FBXO10Q9UK96 956 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 NBASA2RRP1 2371 aa4.56□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TRIM49BA6NDI0 452 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 C10orf142B7Z368 130 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 PRRT4C9JH25 899 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TULP2O00295 520 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 CETN3O15182 167 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 STX10O60499 249 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 RHOBTB1O94844 696 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 ABL1P00519 1130 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 IGLV3-27P01718 113 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 IRF1P10914 325 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 EPB41P11171 864 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 RARGP13631 454 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 CEACAM1P13688 526 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TYRP14679 529 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 GABRG2P18507 467 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TIE1P35590 1138 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 PTGER3P43115 390 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 PLA2G4AP47712 749 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 RPL34P49207 117 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 BCAT1P54687 386 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 MFAP3P55082 362 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 MARSP56192 900 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 SPDYCQ5MJ68 293 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 EOGTQ5NDL2 527 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 EMC10Q5UCC4 262 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 GRAMD4Q6IC98 578 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 KIAA1211LQ6NV74 962 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 SCML4Q8N228 414 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 CPXM2Q8N436 756 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 CCDC33Q8N5R6 958 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 FRMD1Q8N878 549 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 ANKRD52Q8NB46 1076 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 JAKMIP2Q96AA8 810 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TMEM176AQ96HP8 235 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 TIGD1Q96MW7 591 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 ACOX2Q99424 681 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 EDEM2Q9BV94 578 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 CD93Q9NPY3 652 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 RMND1Q9NWS8 449 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 DEC1Q9P2X7 70 aa4.55□□□□□ -1.68
PHF20-212ENST00000485604 DNMT3LQ9UJW3 386 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms