RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	PLK2	Q9NYY3	685 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	CACNA1B	Q00975	2339 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307		M0QYV0	167 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	AP5Z1	O43299	807 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	IGLV3-25	P01717	112 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	NCAM1	P13591	858 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	CCDC6	Q16204	474 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	PPM1J	Q5JR12	505 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	IL31	Q6EBC2	164 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	CEP76	Q8TAP6	659 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	UCMA	Q8WVF2	138 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	RLN3	Q8WXF3	142 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	SHC3	Q92529	594 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	EDEM1	Q92611	657 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	TCEAL3	Q969E4	200 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	EDEM2	Q9BV94	578 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM245	Q9H330	911 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	CAPN10	Q9HC96	672 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	INVS	Q9Y283	1065 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	BECN2	A8MW95	431 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	HMBS	P08397	361 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	LCP1	P13796	627 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	HLA-F	P30511	346 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	IL12RB1	P42701	662 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	PTGER3	P43115	390 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	RGS7	P49802	495 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	SHC2	P98077	582 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	LMAN2	Q12907	356 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	ARID5B	Q14865	1188 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	FUT11	Q495W5	492 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	FRMD1	Q8N878	549 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	KDM1B	Q8NB78	822 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	SERPINB11	Q96P15	392 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	THAP9	Q9H5L6	903 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	FBRS	Q9HAH7	460 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	USP24	Q9UPU5	2620 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	WASH3P	C4AMC7	463 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	MED7	O43513	233 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	ACSL4	O60488	711 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	GLI1	P08151	1106 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	PML	P29590	882 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	COPA	P53621	1224 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF234	Q14588	700 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	STARD3	Q14849	445 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	GBP6	Q6ZN66	633 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	DDI1	Q8WTU0	396 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	LHX5	Q9H2C1	402 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	SIX2	Q9NPC8	291 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PGAP2-215	ENST00000469307	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		12.85	□□□□□ -0.35

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