RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465158.5

RBM39-225, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 825 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-225	ENST00000465158	PRRG1	O14668	218 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	PRPSAP2	O60256	369 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	B4GALT3	O60512	393 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	DAB1	O75553	588 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	LTF	P02788	710 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	LCP1	P13796	627 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	YWHAQ	P27348	245 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	HTR7	P34969	479 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	DAOA	P59103	153 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	ERVK-21	P61565	698 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	ROR1	Q01973	937 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	ADIG	Q0VDE8	80 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	PDK2	Q15119	407 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	PTPRO	Q16827	1216 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	EXD1	Q8NHP7	514 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	RNF139	Q8WU17	664 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	TEKT4	Q8WW24	435 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	WDR24	Q96S15	920 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	SMO	Q99835	787 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	GDF15	Q99988	308 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	ZBP1	Q9H171	429 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	IL37	Q9NZH6	218 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	COG5	Q9UP83	839 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	NME7	Q9Y5B8	376 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	CLUH	O75153	1309 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	HHLA1	C9JL84	531 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158		H3BNC9	293 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	CCDC188	H7C350	402 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	KCNK3	O14649	394 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	TNFRSF10B	O14763	440 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	NDC80	O14777	642 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	MDM4	O15151	490 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	ENDOD1	O94919	500 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	TJP3	O95049	919 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	LRG1	P02750	347 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	CTAGE8	P0CG41	777 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	COMT	P21964	271 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	CYP2F1	P24903	491 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	MCM3	P25205	808 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	KLRC2	P26717	231 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	HOXA9	P31269	272 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	RGS19	P49795	217 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	RGS7	P49802	495 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	TUB	P50607	506 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	SLC5A3	P53794	718 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	EPHB4	P54760	987 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	ARPP19	P56211	112 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	LMNB2	Q03252	620 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	ADCY1	Q08828	1119 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	DUSP4	Q13115	394 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	MYO9B	Q13459	2157 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	SHH	Q15465	462 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-225	ENST00000465158	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29

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