RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	LZTR1	Q8N653	840 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	INPP5D	Q92835	1189 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	RRAGC	Q9HB90	399 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT82	Q9NSB4	513 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	DTL	Q9NZJ0	730 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	FNIP2	Q9P278	1114 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	GJD2	Q9UKL4	321 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	PLXNA3	P51805	1871 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM159B	A6NKW6	160 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	C2CD2L	O14523	706 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	PTGES	O14684	152 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	SPTLC1	O15269	473 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	AP1G2	O75843	785 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	LTF	P02788	710 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	POLB	P06746	335 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	CREB1	P16220	341 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	TYMP	P19971	482 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	LMO2	P25791	158 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	CCNF	P41002	786 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	DAOA	P59103	153 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	TPI1	P60174	286 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	ADCY1	Q08828	1119 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	GALNTL6	Q49A17	601 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	MSS51	Q4VC12	460 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	WSCD1	Q658N2	575 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	RFX8	Q6ZV50	586 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	LINC00523	Q86TU6	105 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM35A	Q86V20	835 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	MZB1	Q8WU39	189 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	KLHL29	Q96CT2	875 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	CFAP36	Q96G28	342 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	MID2	Q9UJV3	735 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	USP3	Q9Y6I4	520 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	DNM1L	O00429	736 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	CA12	O43570	354 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	ALDH1A2	O94788	518 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	CYBA	P13498	195 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	CCNB1	P14635	433 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	GOT1	P17174	413 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	ADRA1B	P35368	520 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	NPY2R	P49146	381 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	NEK3	P51956	506 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	BEX3	Q00994	111 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	AP1B1	Q10567	949 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	TUSC3	Q13454	348 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	DPYS	Q14117	519 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	MPP2	Q14168	576 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	TBCC	Q15814	346 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	CA9	Q16790	459 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	INSC	Q1MX18	579 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-222	ENST00000459758	LCA5	Q86VQ0	697 aa		11.86	□□□□□ -0.51

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