RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 WASF3Q9UPY6 502 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 PKD1L2Q7Z442 2459 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 MEI4A8MW99 385 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNJ18B7U540 433 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 PIK3R2O00459 728 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 PSMA7O14818 248 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 NPC1O15118 1278 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 OPHN1O60890 802 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 CALCAP01258 141 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 PROS1P07225 676 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 SETSIPP0DME0 302 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 VDRP11473 427 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 HLA-EP13747 358 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 PRKCHP24723 683 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 FMO5P49326 533 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 HARS2P49590 506 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 SEMA3BQ13214 749 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 ENPP2Q13822 863 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF234Q14588 700 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 PLEKHG6Q3KR16 790 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR45BQ5MNZ6 344 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 SYCP2LQ5T4T6 812 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM215Q68D42 235 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM270Q6UE05 265 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM217AQ8IXS0 508 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 PIP4P2Q8N4L2 257 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 SPATA20Q8TB22 786 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 FOXJ1Q92949 421 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 KAT5Q92993 513 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 SIPA1Q96FS4 1042 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 ZSWIM1Q9BR11 485 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 GPR174Q9BXC1 333 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC2A11Q9BYW1 496 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 KIAA1257Q9ULG3 409 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 UPK3BL1B0FP48 263 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 UPK3BL2E5RIL1 263 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 TIMM44O43615 452 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 GABBR2O75899 941 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 EPHX1P07099 455 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 SYPP08247 313 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 GNSP15586 552 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 CD44P16070 742 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 BRD2P25440 801 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 TPMTP51580 245 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 DAOAP59103 153 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 ARID5AQ03989 594 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 STIM1Q13586 685 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC40Q4G0X9 1142 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 PKDCCQ504Y2 493 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 MPPE1Q53F39 396 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 ADGRF1Q5T601 910 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 PMF1Q6P1K2 205 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 LCLAT1Q6UWP7 414 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 KCTD13Q8WZ19 329 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 NT5C1BQ96P26 610 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 SCNM1Q9BWG6 230 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 ADAM33Q9BZ11 813 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 CNGB3Q9NQW8 809 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 ITM2CQ9NQX7 267 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 SUSD2Q9UGT4 822 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 MAN1B1Q9UKM7 699 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 M0QYV0 167 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 PAEPP09466 180 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 NCAM1P13591 858 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 CD59P13987 128 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 HLA-FP30511 346 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 OXTRP30559 389 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF132P52740 706 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 COPAP53621 1224 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM193AP78312 1265 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 GRIK2Q13002 908 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 E2F5Q15329 346 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms