RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 TKTL1P51854 596 aa10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 CASP5P51878 434 aa10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 NDST1P52848 882 aa10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 ZNF280DQ6N043 979 aa10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 ZFP1Q6P2D0 407 aa10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 SLC27A1Q6PCB7 646 aa10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 DHDDSQ86SQ9 333 aa10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 KATNAL2Q8IYT4 538 aa10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 EPS8L1Q8TE68 723 aa10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 VCPIP1Q96JH7 1222 aa10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 ZNF333Q96JL9 665 aa10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 SYT15Q9BQS2 421 aa10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 AP4E1Q9UPM8 1137 aa10.27□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 FRMPD4Q14CM0 1322 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 F5H5T6 163 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 MAPTP10636 758 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 RAG1P15918 1043 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 TSHRP16473 764 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 HADHBP55084 474 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 KRT72Q14CN4 511 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 ARHGEF19Q8IW93 802 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 TERB1Q8NA31 727 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 HAS1Q92839 578 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 TMEM121Q9BTD3 319 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 PHACTR1Q9C0D0 580 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 C10orf88Q9H8K7 445 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 GPAMQ9HCL2 828 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 CD274Q9NZQ7 290 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 CRLS1Q9UJA2 301 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 SNX5Q9Y5X3 404 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 ASTN1O14525 1302 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 H7C4K7 107 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 TCEA3O75764 348 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 CNTFP26441 200 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 CDK7P50613 346 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 PDK2Q15119 407 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 PDK3Q15120 406 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 OASLQ15646 514 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 NFIL3Q16649 462 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 RRM2BQ7LG56 351 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 LINC00523Q86TU6 105 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 EDEM1Q92611 657 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 THAP1Q9NVV9 213 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 CLIC5Q9NZA1 410 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 TSPAN16Q9UKR8 245 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 CHKBQ9Y259 395 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 NR2E1Q9Y466 385 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 PRR23AA6NEV1 266 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 SPDYE5A6NIY4 337 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 TISP43B9A030 160 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 MAGEC1O60732 1142 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 LSM8O95777 96 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 INPP5AQ14642 412 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 VSTM1Q6UX27 236 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 DEFB107AQ8IZN7 70 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 APOL5Q9BWW9 433 aa10.26□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 MEIS2O14770 477 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 RHOBTB1O94844 696 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 SSTR1P30872 391 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 NUDT2P50583 147 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 EVX2Q03828 476 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 LPCAT2Q7L5N7 544 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 BRSK2Q8IWQ3 736 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 COPS5Q92905 334 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 ARL8BQ9NVJ2 186 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 SUPT3HB4E1H0 165 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 FDFT1P37268 417 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 JAM2P57087 298 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 BEX3Q00994 111 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 BST2Q10589 180 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 MFSD10Q14728 455 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 SGO1Q5FBB7 561 aa10.25□□□□□ -0.77
TNS1-209ENST00000446688 MOB2Q70IA6 237 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms