RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436724.5

PTPRF-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 2,168 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-207ENST00000436724 CPT1BQ92523 772 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 CASP10Q92851 521 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 H3BRJ5 948 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 MFSD11O43934 449 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 SCAPQ12770 1279 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 DUSP4Q13115 394 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 SYCP2LQ5T4T6 812 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 RFX8Q6ZV50 586 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 RNF34Q969K3 372 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa21.84■■□□□ 1.09
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PTPRF-207ENST00000436724 MAGEA11P43364 429 aa21.84■■□□□ 1.09
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PTPRF-207ENST00000436724 SEMA3BQ13214 749 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 KYNUQ16719 465 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 TP53INP2Q8IXH6 220 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 IGSF21Q96ID5 467 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
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PTPRF-207ENST00000436724 EFEMP2O95967 443 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 NUDT17P0C025 328 aa21.84■■□□□ 1.09
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PTPRF-207ENST00000436724 MTM1Q13496 603 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 DPYSQ14117 519 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 MORF4L2Q15014 288 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 ARL13BQ3SXY8 428 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 EMC10Q5UCC4 262 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 C9orf72Q96LT7 481 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.83■■□□□ 1.09
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PTPRF-207ENST00000436724 H7C4K7 107 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 IRAK2O43187 625 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 AIF1P55008 147 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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PTPRF-207ENST00000436724 TMBIM4Q9HC24 238 aa21.83■■□□□ 1.09
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PTPRF-207ENST00000436724 SCML2Q9UQR0 700 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 WDR27A2RRH5 827 aa21.82■■□□□ 1.08
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PTPRF-207ENST00000436724 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.82■■□□□ 1.08
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PTPRF-207ENST00000436724 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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PTPRF-207ENST00000436724 OR12D3Q9UGF7 316 aa21.82■■□□□ 1.08
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PTPRF-207ENST00000436724 OR1D2P34982 312 aa21.82■■□□□ 1.08
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PTPRF-207ENST00000436724 SMOC2Q9H3U7 446 aa21.82■■□□□ 1.08
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PTPRF-207ENST00000436724 TMEM63AO94886 807 aa21.81■■□□□ 1.08
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PTPRF-207ENST00000436724 KDM7AQ6ZMT4 941 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRF-207ENST00000436724 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.81■■□□□ 1.08
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PTPRF-207ENST00000436724 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRF-207ENST00000436724 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRF-207ENST00000436724 SMIM23A6NLE4 172 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRF-207ENST00000436724 KIAA0355O15063 1070 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRF-207ENST00000436724 TTC4O95801 387 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRF-207ENST00000436724 ATP1A2P50993 1020 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRF-207ENST00000436724 KIAA1841Q6NSI8 718 aa21.81■■□□□ 1.08
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