RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAM2Q99965 735 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 LXNQ9BS40 222 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERVK-5Q9HDB9 667 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3GLB2Q9NR46 395 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D22BQ9NU19 505 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCOCQ9UIL1 159 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAM29Q9UKF5 820 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 GIT1Q9Y2X7 761 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF318Q5VUA4 2279 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 OBSL1O75147 1896 aa4.9□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 DMDP11532 3685 aa4.9□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC01565O15544 149 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRP2O60462 931 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEMFO60524 1076 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBX10O75333 385 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMD10O75832 226 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 LY86O95711 162 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MMP1P03956 469 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 C8AP07357 584 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00271P0C7V0 271 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 FDPSP14324 419 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL9P15248 144 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CIITAP33076 1130 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCM7P33993 719 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPC3P51654 580 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPEPPSP55786 919 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAM15Q13444 863 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM29Q14134 588 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD1Q15327 319 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q4G0T1 1027 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCE1DQ5T752 114 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLPP4Q5VZY2 271 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPAINQ86UA6 219 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHPN2Q8IUC4 686 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL36Q8N4N3 616 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 LPPQ93052 612 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 FATE1Q969F0 183 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSPBAP1Q96EW2 488 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL17RAQ96F46 866 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 OSBPL6Q9BZF3 934 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNMB3Q9NPA1 279 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGL1Q9NZL6 768 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 VWA7Q9Y334 891 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZDHHC9Q9Y397 364 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa4.9□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MUC6Q6W4X9 2439 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TECTAO75443 2155 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYH10P35580 1976 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A087WWV3 80 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A087WZ62 844 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PR48 441 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2orf78A6NCI8 922 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 C9orf118A6NHY6 69 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTBD18B2RXH4 712 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 H3BNC9 293 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 USO1O60763 962 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM127O75204 238 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR32O75388 356 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL33O95760 270 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITGB1P05556 798 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 GAAP10253 952 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 SP100P23497 879 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJB1P25685 340 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMOD1P28289 359 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 SFNP31947 248 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFV1P49821 464 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRE11P49959 708 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLURP1P55000 103 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADKP55263 362 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRG3P56975 720 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP3CAQ08209 521 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MALLQ13021 153 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP2R5CQ13362 524 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 FZD5Q13467 585 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 EMC2Q15006 297 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CALCRLQ16602 461 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms