RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 NEK10Q6ZWH5 1172 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO32Q969P5 355 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 GLT1D1Q96MS3 346 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 BCORQ6W2J9 1755 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0G2JLW4 131 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TSC22D2O75157 780 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TNFAIP8O95379 198 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CLTBP09497 229 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 GRK3P35626 688 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 FLT3P36888 993 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 OXCT1P55809 520 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 C11orf88Q6PI97 169 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MPZL3Q6UWV2 235 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SPPL2AQ8TCT8 520 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CENPTQ96BT3 561 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MIEF2Q96C03 454 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CGRRF1Q99675 332 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 DPY30Q9C005 99 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM220BPB1ANY3 271 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PEX1O43933 1283 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ATG7O95352 703 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PARNO95453 639 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 HPGDP15428 266 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ME2P23368 584 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ELK3P41970 407 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CD151P48509 253 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CLCN3P51790 818 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CASP7P55210 303 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PGS1Q32NB8 556 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF720Q7Z2F6 126 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 STK32CQ86UX6 486 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM45AQ8TCE6 357 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TCP10LQ8TDR4 215 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RORBQ92753 470 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 FICDQ9BVA6 458 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.617e-6■■■□□ 17.4
EFTUD2-202ENST00000426333 VANGL2Q9ULK5 521 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEB16A2A368 324 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ST13P50502 369 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NFIL3Q16649 462 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ERO1BQ86YB8 467 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CYLDQ9NQC7 956 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 THAP1Q9NVV9 213 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 GGA3Q9NZ52 723 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 BTBD7Q9P203 1132 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PADI4Q9UM07 663 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 COL4A1P02462 1669 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TK2O00142 265 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RIPK2O43353 540 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 LY75O60449 1722 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MFN2O95140 757 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 YY1P25490 414 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 DHFR2Q86XF0 187 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM126BQ8IXS8 530 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SVOPQ8N4V2 548 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 OMA1Q96E52 524 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PHF21BQ96EK2 531 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 BTBD10Q9BSF8 475 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 COLEC11Q9BWP8 271 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PIF1Q9H611 641 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MIEF1Q9NQG6 463 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RAD18Q9NS91 495 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPC4Q9UBN4 977 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 DYRK1BQ9Y463 629 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF1LQ8IZX4 1826 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM25AB3EWG3 89 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM25CB3EWG5 89 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM25GB3EWG6 89 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SNPHO15079 494 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO21O94952 628 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ICAM1P05362 532 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms