RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 MPPE1Q53F39 396 aa26■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 SYT13Q7L8C5 426 aa26■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB44Q8NCP5 570 aa26■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 ACDQ96AP0 544 aa26■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC39A13Q96H72 371 aa26■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 HHIPQ96QV1 700 aa26■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 STOML2Q9UJZ1 356 aa26■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 CLEC4EQ9ULY5 219 aa26■■□□□ 1.75
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HTATSF1-202ENST00000425695 GABRB2P47870 512 aa25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC26A9Q7LBE3 791 aa25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa25.99■■□□□ 1.75
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HTATSF1-202ENST00000425695 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa25.99■■□□□ 1.75
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HTATSF1-202ENST00000425695 SLC30A5Q8TAD4 765 aa25.99■■□□□ 1.75
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HTATSF1-202ENST00000425695 PRRT4C9JH25 899 aa25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 IRAK2O43187 625 aa25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 DAB1O75553 588 aa25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC6A4P31645 630 aa25.98■■□□□ 1.75
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HTATSF1-202ENST00000425695 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
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HTATSF1-202ENST00000425695 ASCL5Q7RTU5 278 aa25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 IL17RCQ8NAC3 791 aa25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF34Q969K3 372 aa25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 AZIN2Q96A70 460 aa25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1W2PQC6 194 aa25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 IGLV3-25P01717 112 aa25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 APOEP02649 317 aa25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
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HTATSF1-202ENST00000425695 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 BAP1Q92560 729 aa25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
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HTATSF1-202ENST00000425695 MMP17Q9ULZ9 603 aa25.97■■□□□ 1.75
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HTATSF1-202ENST00000425695 WASP42768 502 aa25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1-202ENST00000425695 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
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HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM72Q6ZMU5 477 aa25.96■■□□□ 1.75
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HTATSF1-202ENST00000425695 STIM2Q9P246 746 aa25.96■■□□□ 1.75
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HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF445P59923 1031 aa25.95■■□□□ 1.74
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HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM92Q6UXU6 159 aa25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa25.95■■□□□ 1.74
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HTATSF1-202ENST00000425695 TSPY26PQ9H489 355 aa25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC53A6NM62 1247 aa25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 HRO43593 1189 aa25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAM23O75077 832 aa25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 LMNAP02545 664 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC172P0C7W6 258 aa25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 UNGP13051 313 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 MMP8P22894 467 aa25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 HOXA6P31267 233 aa25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-202ENST00000425695 EOGTQ5NDL2 527 aa25.94■■□□□ 1.74
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